Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQL2

Ccer1, Coiled-coil domain-containing glutamate-rich protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccer1Q9CQL2 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccer1Q9CQL2 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccer1Q9CQL2 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccer1Q9CQL2 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccer1Q9CQL2 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccer1Q9CQL2 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccer1Q9CQL2 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccer1Q9CQL2 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccer1Q9CQL2 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccer1Q9CQL2 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccer1Q9CQL2 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccer1Q9CQL2 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccer1Q9CQL2 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccer1Q9CQL2 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccer1Q9CQL2 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccer1Q9CQL2 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccer1Q9CQL2 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccer1Q9CQL2 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccer1Q9CQL2 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccer1Q9CQL2 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccer1Q9CQL2 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccer1Q9CQL2 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccer1Q9CQL2 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccer1Q9CQL2 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccer1Q9CQL2 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccer1Q9CQL2 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccer1Q9CQL2 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccer1Q9CQL2 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccer1Q9CQL2 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccer1Q9CQL2 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccer1Q9CQL2 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccer1Q9CQL2 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccer1Q9CQL2 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccer1Q9CQL2 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccer1Q9CQL2 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccer1Q9CQL2 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccer1Q9CQL2 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccer1Q9CQL2 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccer1Q9CQL2 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccer1Q9CQL2 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccer1Q9CQL2 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccer1Q9CQL2 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
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Ccer1Q9CQL2 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
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Ccer1Q9CQL2 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccer1Q9CQL2 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccer1Q9CQL2 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccer1Q9CQL2 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccer1Q9CQL2 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccer1Q9CQL2 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccer1Q9CQL2 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccer1Q9CQL2 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccer1Q9CQL2 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccer1Q9CQL2 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccer1Q9CQL2 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccer1Q9CQL2 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccer1Q9CQL2 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccer1Q9CQL2 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccer1Q9CQL2 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccer1Q9CQL2 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccer1Q9CQL2 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccer1Q9CQL2 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccer1Q9CQL2 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccer1Q9CQL2 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccer1Q9CQL2 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccer1Q9CQL2 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
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Ccer1Q9CQL2 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccer1Q9CQL2 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccer1Q9CQL2 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccer1Q9CQL2 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccer1Q9CQL2 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccer1Q9CQL2 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccer1Q9CQL2 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccer1Q9CQL2 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccer1Q9CQL2 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccer1Q9CQL2 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccer1Q9CQL2 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccer1Q9CQL2 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccer1Q9CQL2 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccer1Q9CQL2 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccer1Q9CQL2 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccer1Q9CQL2 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccer1Q9CQL2 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccer1Q9CQL2 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccer1Q9CQL2 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccer1Q9CQL2 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccer1Q9CQL2 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccer1Q9CQL2 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccer1Q9CQL2 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
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Ccer1Q9CQL2 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
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Ccer1Q9CQL2 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
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