Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD1

Rab5a, Ras-related protein Rab-5A, mousemouse

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Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab5aQ9CQD1 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rab5aQ9CQD1 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rab5aQ9CQD1 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Rab5aQ9CQD1 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rab5aQ9CQD1 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rab5aQ9CQD1 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rab5aQ9CQD1 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Rab5aQ9CQD1 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Rab5aQ9CQD1 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Rab5aQ9CQD1 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Rab5aQ9CQD1 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Rab5aQ9CQD1 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Rab5aQ9CQD1 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Rab5aQ9CQD1 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Rab5aQ9CQD1 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Rab5aQ9CQD1 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Rab5aQ9CQD1 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Rab5aQ9CQD1 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Rab5aQ9CQD1 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Rab5aQ9CQD1 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rab5aQ9CQD1 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rab5aQ9CQD1 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rab5aQ9CQD1 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rab5aQ9CQD1 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rab5aQ9CQD1 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rab5aQ9CQD1 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rab5aQ9CQD1 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rab5aQ9CQD1 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rab5aQ9CQD1 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rab5aQ9CQD1 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rab5aQ9CQD1 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rab5aQ9CQD1 Prrc2b-202ENSMUST00000069817 10671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rab5aQ9CQD1 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rab5aQ9CQD1 Gpr26-201ENSMUST00000045840 11571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rab5aQ9CQD1 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rab5aQ9CQD1 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rab5aQ9CQD1 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rab5aQ9CQD1 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rab5aQ9CQD1 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Rab5aQ9CQD1 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Rab5aQ9CQD1 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Rab5aQ9CQD1 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Rab5aQ9CQD1 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Rab5aQ9CQD1 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Rab5aQ9CQD1 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Rab5aQ9CQD1 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rab5aQ9CQD1 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Rab5aQ9CQD1 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Rab5aQ9CQD1 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Rab5aQ9CQD1 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Rab5aQ9CQD1 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Rab5aQ9CQD1 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Rab5aQ9CQD1 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Rab5aQ9CQD1 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Rab5aQ9CQD1 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Rab5aQ9CQD1 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rab5aQ9CQD1 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rab5aQ9CQD1 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rab5aQ9CQD1 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Rab5aQ9CQD1 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Rab5aQ9CQD1 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rab5aQ9CQD1 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rab5aQ9CQD1 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rab5aQ9CQD1 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rab5aQ9CQD1 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rab5aQ9CQD1 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rab5aQ9CQD1 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rab5aQ9CQD1 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rab5aQ9CQD1 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rab5aQ9CQD1 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rab5aQ9CQD1 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rab5aQ9CQD1 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rab5aQ9CQD1 Tmem8b-201ENSMUST00000107864 4726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rab5aQ9CQD1 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Rab5aQ9CQD1 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rab5aQ9CQD1 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rab5aQ9CQD1 Slc44a1-204ENSMUST00000107647 2176 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rab5aQ9CQD1 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rab5aQ9CQD1 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rab5aQ9CQD1 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rab5aQ9CQD1 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rab5aQ9CQD1 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rab5aQ9CQD1 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rab5aQ9CQD1 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rab5aQ9CQD1 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rab5aQ9CQD1 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rab5aQ9CQD1 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rab5aQ9CQD1 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rab5aQ9CQD1 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rab5aQ9CQD1 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rab5aQ9CQD1 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rab5aQ9CQD1 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rab5aQ9CQD1 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rab5aQ9CQD1 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rab5aQ9CQD1 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rab5aQ9CQD1 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rab5aQ9CQD1 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rab5aQ9CQD1 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rab5aQ9CQD1 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Rab5aQ9CQD1 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
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