Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQA6

Chchd1, Coiled-coil-helix-coiled-coil-helix domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chchd1Q9CQA6 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Chchd1Q9CQA6 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Chchd1Q9CQA6 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Chchd1Q9CQA6 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Chchd1Q9CQA6 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Chchd1Q9CQA6 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Chchd1Q9CQA6 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Chchd1Q9CQA6 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Chchd1Q9CQA6 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Chchd1Q9CQA6 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Chchd1Q9CQA6 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Chchd1Q9CQA6 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Chchd1Q9CQA6 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Chchd1Q9CQA6 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Chchd1Q9CQA6 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Chchd1Q9CQA6 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Chchd1Q9CQA6 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Chchd1Q9CQA6 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Chchd1Q9CQA6 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Chchd1Q9CQA6 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Chchd1Q9CQA6 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Chchd1Q9CQA6 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Chchd1Q9CQA6 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Chchd1Q9CQA6 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Chchd1Q9CQA6 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Chchd1Q9CQA6 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Chchd1Q9CQA6 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Chchd1Q9CQA6 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Chchd1Q9CQA6 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Chchd1Q9CQA6 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Chchd1Q9CQA6 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Chchd1Q9CQA6 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Chchd1Q9CQA6 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Chchd1Q9CQA6 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Chchd1Q9CQA6 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Chchd1Q9CQA6 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Chchd1Q9CQA6 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Chchd1Q9CQA6 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Chchd1Q9CQA6 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Chchd1Q9CQA6 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Chchd1Q9CQA6 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Chchd1Q9CQA6 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Chchd1Q9CQA6 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Chchd1Q9CQA6 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Chchd1Q9CQA6 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Chchd1Q9CQA6 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Chchd1Q9CQA6 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Chchd1Q9CQA6 Grhl2-201ENSMUST00000022895 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Chchd1Q9CQA6 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Chchd1Q9CQA6 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Chchd1Q9CQA6 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Chchd1Q9CQA6 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Chchd1Q9CQA6 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Chchd1Q9CQA6 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Chchd1Q9CQA6 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Chchd1Q9CQA6 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Chchd1Q9CQA6 Grm5-201ENSMUST00000107263 3516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Chchd1Q9CQA6 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Chchd1Q9CQA6 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Chchd1Q9CQA6 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Chchd1Q9CQA6 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Chchd1Q9CQA6 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Chchd1Q9CQA6 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Chchd1Q9CQA6 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Chchd1Q9CQA6 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Chchd1Q9CQA6 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Chchd1Q9CQA6 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Chchd1Q9CQA6 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Chchd1Q9CQA6 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Chchd1Q9CQA6 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Chchd1Q9CQA6 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Chchd1Q9CQA6 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Chchd1Q9CQA6 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Chchd1Q9CQA6 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Chchd1Q9CQA6 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Chchd1Q9CQA6 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Chchd1Q9CQA6 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Chchd1Q9CQA6 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Chchd1Q9CQA6 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Chchd1Q9CQA6 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Chchd1Q9CQA6 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Chchd1Q9CQA6 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Chchd1Q9CQA6 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Chchd1Q9CQA6 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Chchd1Q9CQA6 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Chchd1Q9CQA6 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Chchd1Q9CQA6 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Chchd1Q9CQA6 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Chchd1Q9CQA6 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Chchd1Q9CQA6 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Chchd1Q9CQA6 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Chchd1Q9CQA6 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Chchd1Q9CQA6 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Chchd1Q9CQA6 Ffar1-201ENSMUST00000052700 4175 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Chchd1Q9CQA6 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Chchd1Q9CQA6 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Chchd1Q9CQA6 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Chchd1Q9CQA6 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Chchd1Q9CQA6 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Chchd1Q9CQA6 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms