Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ73

Pkp2, Plakophilin 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp2Q9CQ73 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pkp2Q9CQ73 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pkp2Q9CQ73 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pkp2Q9CQ73 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pkp2Q9CQ73 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pkp2Q9CQ73 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pkp2Q9CQ73 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pkp2Q9CQ73 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pkp2Q9CQ73 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pkp2Q9CQ73 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pkp2Q9CQ73 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pkp2Q9CQ73 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pkp2Q9CQ73 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pkp2Q9CQ73 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pkp2Q9CQ73 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pkp2Q9CQ73 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pkp2Q9CQ73 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pkp2Q9CQ73 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pkp2Q9CQ73 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pkp2Q9CQ73 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pkp2Q9CQ73 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pkp2Q9CQ73 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pkp2Q9CQ73 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pkp2Q9CQ73 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pkp2Q9CQ73 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pkp2Q9CQ73 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Pkp2Q9CQ73 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pkp2Q9CQ73 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Pkp2Q9CQ73 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pkp2Q9CQ73 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Pkp2Q9CQ73 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Pkp2Q9CQ73 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pkp2Q9CQ73 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pkp2Q9CQ73 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Pkp2Q9CQ73 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pkp2Q9CQ73 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pkp2Q9CQ73 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Pkp2Q9CQ73 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pkp2Q9CQ73 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pkp2Q9CQ73 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pkp2Q9CQ73 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pkp2Q9CQ73 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pkp2Q9CQ73 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pkp2Q9CQ73 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pkp2Q9CQ73 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pkp2Q9CQ73 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pkp2Q9CQ73 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pkp2Q9CQ73 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Pkp2Q9CQ73 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pkp2Q9CQ73 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pkp2Q9CQ73 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pkp2Q9CQ73 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pkp2Q9CQ73 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pkp2Q9CQ73 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pkp2Q9CQ73 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Pkp2Q9CQ73 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pkp2Q9CQ73 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Pkp2Q9CQ73 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Pkp2Q9CQ73 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pkp2Q9CQ73 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Pkp2Q9CQ73 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pkp2Q9CQ73 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pkp2Q9CQ73 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pkp2Q9CQ73 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pkp2Q9CQ73 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pkp2Q9CQ73 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pkp2Q9CQ73 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pkp2Q9CQ73 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pkp2Q9CQ73 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pkp2Q9CQ73 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pkp2Q9CQ73 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pkp2Q9CQ73 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pkp2Q9CQ73 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pkp2Q9CQ73 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pkp2Q9CQ73 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pkp2Q9CQ73 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pkp2Q9CQ73 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pkp2Q9CQ73 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Pkp2Q9CQ73 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pkp2Q9CQ73 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pkp2Q9CQ73 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pkp2Q9CQ73 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Pkp2Q9CQ73 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pkp2Q9CQ73 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pkp2Q9CQ73 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pkp2Q9CQ73 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pkp2Q9CQ73 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Pkp2Q9CQ73 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pkp2Q9CQ73 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pkp2Q9CQ73 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pkp2Q9CQ73 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Pkp2Q9CQ73 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pkp2Q9CQ73 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pkp2Q9CQ73 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Pkp2Q9CQ73 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Pkp2Q9CQ73 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pkp2Q9CQ73 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pkp2Q9CQ73 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pkp2Q9CQ73 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pkp2Q9CQ73 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms