Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ36

Pole4, DNA polymerase epsilon subunit 4, mousemouse

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Length 118 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pole4Q9CQ36 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pole4Q9CQ36 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pole4Q9CQ36 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pole4Q9CQ36 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pole4Q9CQ36 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pole4Q9CQ36 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pole4Q9CQ36 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pole4Q9CQ36 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pole4Q9CQ36 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pole4Q9CQ36 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pole4Q9CQ36 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pole4Q9CQ36 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pole4Q9CQ36 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pole4Q9CQ36 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pole4Q9CQ36 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pole4Q9CQ36 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pole4Q9CQ36 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pole4Q9CQ36 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pole4Q9CQ36 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pole4Q9CQ36 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pole4Q9CQ36 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pole4Q9CQ36 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pole4Q9CQ36 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pole4Q9CQ36 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pole4Q9CQ36 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pole4Q9CQ36 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pole4Q9CQ36 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pole4Q9CQ36 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pole4Q9CQ36 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pole4Q9CQ36 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pole4Q9CQ36 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pole4Q9CQ36 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Pole4Q9CQ36 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Pole4Q9CQ36 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pole4Q9CQ36 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Pole4Q9CQ36 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pole4Q9CQ36 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Pole4Q9CQ36 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pole4Q9CQ36 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pole4Q9CQ36 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pole4Q9CQ36 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pole4Q9CQ36 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pole4Q9CQ36 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pole4Q9CQ36 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pole4Q9CQ36 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pole4Q9CQ36 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pole4Q9CQ36 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pole4Q9CQ36 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pole4Q9CQ36 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pole4Q9CQ36 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pole4Q9CQ36 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pole4Q9CQ36 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pole4Q9CQ36 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pole4Q9CQ36 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pole4Q9CQ36 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pole4Q9CQ36 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pole4Q9CQ36 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pole4Q9CQ36 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pole4Q9CQ36 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pole4Q9CQ36 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pole4Q9CQ36 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pole4Q9CQ36 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pole4Q9CQ36 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pole4Q9CQ36 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pole4Q9CQ36 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pole4Q9CQ36 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pole4Q9CQ36 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pole4Q9CQ36 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pole4Q9CQ36 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Pole4Q9CQ36 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pole4Q9CQ36 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pole4Q9CQ36 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pole4Q9CQ36 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Pole4Q9CQ36 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pole4Q9CQ36 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pole4Q9CQ36 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pole4Q9CQ36 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pole4Q9CQ36 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pole4Q9CQ36 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pole4Q9CQ36 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Pole4Q9CQ36 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pole4Q9CQ36 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pole4Q9CQ36 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Pole4Q9CQ36 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Pole4Q9CQ36 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Pole4Q9CQ36 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Pole4Q9CQ36 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Pole4Q9CQ36 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Pole4Q9CQ36 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Pole4Q9CQ36 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Pole4Q9CQ36 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Pole4Q9CQ36 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Pole4Q9CQ36 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pole4Q9CQ36 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pole4Q9CQ36 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pole4Q9CQ36 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Pole4Q9CQ36 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pole4Q9CQ36 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Pole4Q9CQ36 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Pole4Q9CQ36 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms