Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ10

Chmp3, Charged multivesicular body protein 3, mousemouse

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp3Q9CQ10 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Chmp3Q9CQ10 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Chmp3Q9CQ10 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Chmp3Q9CQ10 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Chmp3Q9CQ10 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Chmp3Q9CQ10 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Chmp3Q9CQ10 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Chmp3Q9CQ10 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Chmp3Q9CQ10 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Chmp3Q9CQ10 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Chmp3Q9CQ10 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Chmp3Q9CQ10 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Chmp3Q9CQ10 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Chmp3Q9CQ10 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Chmp3Q9CQ10 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Chmp3Q9CQ10 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Chmp3Q9CQ10 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Chmp3Q9CQ10 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Chmp3Q9CQ10 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Chmp3Q9CQ10 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Chmp3Q9CQ10 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Chmp3Q9CQ10 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Chmp3Q9CQ10 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Chmp3Q9CQ10 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Chmp3Q9CQ10 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Chmp3Q9CQ10 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Chmp3Q9CQ10 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Chmp3Q9CQ10 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Chmp3Q9CQ10 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Chmp3Q9CQ10 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Chmp3Q9CQ10 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Chmp3Q9CQ10 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Chmp3Q9CQ10 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Chmp3Q9CQ10 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Chmp3Q9CQ10 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Chmp3Q9CQ10 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Chmp3Q9CQ10 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Chmp3Q9CQ10 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Chmp3Q9CQ10 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Chmp3Q9CQ10 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Chmp3Q9CQ10 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Chmp3Q9CQ10 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Chmp3Q9CQ10 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Chmp3Q9CQ10 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Chmp3Q9CQ10 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Chmp3Q9CQ10 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Chmp3Q9CQ10 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Chmp3Q9CQ10 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Chmp3Q9CQ10 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Chmp3Q9CQ10 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Chmp3Q9CQ10 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Chmp3Q9CQ10 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Chmp3Q9CQ10 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Chmp3Q9CQ10 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Chmp3Q9CQ10 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Chmp3Q9CQ10 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Chmp3Q9CQ10 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Chmp3Q9CQ10 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Chmp3Q9CQ10 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Chmp3Q9CQ10 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Chmp3Q9CQ10 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Chmp3Q9CQ10 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Chmp3Q9CQ10 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Chmp3Q9CQ10 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Chmp3Q9CQ10 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Chmp3Q9CQ10 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Chmp3Q9CQ10 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Chmp3Q9CQ10 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Chmp3Q9CQ10 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Chmp3Q9CQ10 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Chmp3Q9CQ10 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Chmp3Q9CQ10 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Chmp3Q9CQ10 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Chmp3Q9CQ10 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Chmp3Q9CQ10 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Chmp3Q9CQ10 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Chmp3Q9CQ10 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Chmp3Q9CQ10 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Chmp3Q9CQ10 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Chmp3Q9CQ10 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Chmp3Q9CQ10 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Chmp3Q9CQ10 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Chmp3Q9CQ10 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Chmp3Q9CQ10 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Chmp3Q9CQ10 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Chmp3Q9CQ10 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Chmp3Q9CQ10 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Chmp3Q9CQ10 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Chmp3Q9CQ10 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Chmp3Q9CQ10 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Chmp3Q9CQ10 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Chmp3Q9CQ10 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Chmp3Q9CQ10 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Chmp3Q9CQ10 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Chmp3Q9CQ10 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Chmp3Q9CQ10 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Chmp3Q9CQ10 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Chmp3Q9CQ10 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Chmp3Q9CQ10 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Chmp3Q9CQ10 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
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