Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPR8

Nsmce3, Non-structural maintenance of chromosomes element 3 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 279 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nsmce3Q9CPR8 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Nsmce3Q9CPR8 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Nsmce3Q9CPR8 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Nsmce3Q9CPR8 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Nsmce3Q9CPR8 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Nsmce3Q9CPR8 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Nsmce3Q9CPR8 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Nsmce3Q9CPR8 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Nsmce3Q9CPR8 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Nsmce3Q9CPR8 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Nsmce3Q9CPR8 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Nsmce3Q9CPR8 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Nsmce3Q9CPR8 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Nsmce3Q9CPR8 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Nsmce3Q9CPR8 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Nsmce3Q9CPR8 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Nsmce3Q9CPR8 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Nsmce3Q9CPR8 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Nsmce3Q9CPR8 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Nsmce3Q9CPR8 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Nsmce3Q9CPR8 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Nsmce3Q9CPR8 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Nsmce3Q9CPR8 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Nsmce3Q9CPR8 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Nsmce3Q9CPR8 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Nsmce3Q9CPR8 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Nsmce3Q9CPR8 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Nsmce3Q9CPR8 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Nsmce3Q9CPR8 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Nsmce3Q9CPR8 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Nsmce3Q9CPR8 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Nsmce3Q9CPR8 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Nsmce3Q9CPR8 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Nsmce3Q9CPR8 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Nsmce3Q9CPR8 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Nsmce3Q9CPR8 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Nsmce3Q9CPR8 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Nsmce3Q9CPR8 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Nsmce3Q9CPR8 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Nsmce3Q9CPR8 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Nsmce3Q9CPR8 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Nsmce3Q9CPR8 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Nsmce3Q9CPR8 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Nsmce3Q9CPR8 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Nsmce3Q9CPR8 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Nsmce3Q9CPR8 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Nsmce3Q9CPR8 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Nsmce3Q9CPR8 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Nsmce3Q9CPR8 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Nsmce3Q9CPR8 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Nsmce3Q9CPR8 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Nsmce3Q9CPR8 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Nsmce3Q9CPR8 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Nsmce3Q9CPR8 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Nsmce3Q9CPR8 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Nsmce3Q9CPR8 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Nsmce3Q9CPR8 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Nsmce3Q9CPR8 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Nsmce3Q9CPR8 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Nsmce3Q9CPR8 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Nsmce3Q9CPR8 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Nsmce3Q9CPR8 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Nsmce3Q9CPR8 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Nsmce3Q9CPR8 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Nsmce3Q9CPR8 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Nsmce3Q9CPR8 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Nsmce3Q9CPR8 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Nsmce3Q9CPR8 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Nsmce3Q9CPR8 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Nsmce3Q9CPR8 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Nsmce3Q9CPR8 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Nsmce3Q9CPR8 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Nsmce3Q9CPR8 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Nsmce3Q9CPR8 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Nsmce3Q9CPR8 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Nsmce3Q9CPR8 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Nsmce3Q9CPR8 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Nsmce3Q9CPR8 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Nsmce3Q9CPR8 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Nsmce3Q9CPR8 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Nsmce3Q9CPR8 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Nsmce3Q9CPR8 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Nsmce3Q9CPR8 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Nsmce3Q9CPR8 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Nsmce3Q9CPR8 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Nsmce3Q9CPR8 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Nsmce3Q9CPR8 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Nsmce3Q9CPR8 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Nsmce3Q9CPR8 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Nsmce3Q9CPR8 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Nsmce3Q9CPR8 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Nsmce3Q9CPR8 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Nsmce3Q9CPR8 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Nsmce3Q9CPR8 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Nsmce3Q9CPR8 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Nsmce3Q9CPR8 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Nsmce3Q9CPR8 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Nsmce3Q9CPR8 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Nsmce3Q9CPR8 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Nsmce3Q9CPR8 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.9 ms