Protein–RNA interactions for Protein: Q99PV0

Prpf8, Pre-mRNA-processing-splicing factor 8, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf8Q99PV0 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Prpf8Q99PV0 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Prpf8Q99PV0 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Prpf8Q99PV0 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Prpf8Q99PV0 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Prpf8Q99PV0 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Prpf8Q99PV0 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Prpf8Q99PV0 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Prpf8Q99PV0 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Prpf8Q99PV0 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Prpf8Q99PV0 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Prpf8Q99PV0 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Prpf8Q99PV0 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Prpf8Q99PV0 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Prpf8Q99PV0 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Prpf8Q99PV0 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Prpf8Q99PV0 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Prpf8Q99PV0 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Prpf8Q99PV0 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Prpf8Q99PV0 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Prpf8Q99PV0 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Prpf8Q99PV0 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Prpf8Q99PV0 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Prpf8Q99PV0 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Prpf8Q99PV0 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Prpf8Q99PV0 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Prpf8Q99PV0 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Prpf8Q99PV0 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Prpf8Q99PV0 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Prpf8Q99PV0 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Prpf8Q99PV0 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Prpf8Q99PV0 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Prpf8Q99PV0 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Prpf8Q99PV0 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Prpf8Q99PV0 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Prpf8Q99PV0 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Prpf8Q99PV0 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Prpf8Q99PV0 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Prpf8Q99PV0 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Prpf8Q99PV0 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Prpf8Q99PV0 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Prpf8Q99PV0 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Prpf8Q99PV0 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Prpf8Q99PV0 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Prpf8Q99PV0 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Prpf8Q99PV0 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Prpf8Q99PV0 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Prpf8Q99PV0 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Prpf8Q99PV0 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Prpf8Q99PV0 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Prpf8Q99PV0 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Prpf8Q99PV0 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Prpf8Q99PV0 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Prpf8Q99PV0 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Prpf8Q99PV0 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Prpf8Q99PV0 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Prpf8Q99PV0 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Prpf8Q99PV0 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Prpf8Q99PV0 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Prpf8Q99PV0 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Prpf8Q99PV0 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Prpf8Q99PV0 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Prpf8Q99PV0 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Prpf8Q99PV0 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Prpf8Q99PV0 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Prpf8Q99PV0 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Prpf8Q99PV0 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Prpf8Q99PV0 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Prpf8Q99PV0 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Prpf8Q99PV0 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Prpf8Q99PV0 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Prpf8Q99PV0 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Prpf8Q99PV0 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Prpf8Q99PV0 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Prpf8Q99PV0 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Prpf8Q99PV0 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Prpf8Q99PV0 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Prpf8Q99PV0 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Prpf8Q99PV0 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Prpf8Q99PV0 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Prpf8Q99PV0 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Prpf8Q99PV0 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Prpf8Q99PV0 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Prpf8Q99PV0 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Prpf8Q99PV0 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Prpf8Q99PV0 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Prpf8Q99PV0 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Prpf8Q99PV0 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Prpf8Q99PV0 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Prpf8Q99PV0 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Prpf8Q99PV0 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Prpf8Q99PV0 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Prpf8Q99PV0 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Prpf8Q99PV0 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Prpf8Q99PV0 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Prpf8Q99PV0 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Prpf8Q99PV0 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Prpf8Q99PV0 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Prpf8Q99PV0 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Prpf8Q99PV0 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.1 ms