Protein–RNA interactions for Protein: Q99NF2

Nsmf, NMDA receptor synaptonuclear signaling and neuronal migration factor, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NsmfQ99NF2 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
NsmfQ99NF2 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NsmfQ99NF2 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NsmfQ99NF2 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NsmfQ99NF2 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NsmfQ99NF2 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
NsmfQ99NF2 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NsmfQ99NF2 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NsmfQ99NF2 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NsmfQ99NF2 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
NsmfQ99NF2 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NsmfQ99NF2 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NsmfQ99NF2 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NsmfQ99NF2 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NsmfQ99NF2 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NsmfQ99NF2 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NsmfQ99NF2 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NsmfQ99NF2 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NsmfQ99NF2 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NsmfQ99NF2 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NsmfQ99NF2 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NsmfQ99NF2 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NsmfQ99NF2 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NsmfQ99NF2 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NsmfQ99NF2 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NsmfQ99NF2 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NsmfQ99NF2 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NsmfQ99NF2 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NsmfQ99NF2 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NsmfQ99NF2 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NsmfQ99NF2 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NsmfQ99NF2 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NsmfQ99NF2 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NsmfQ99NF2 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NsmfQ99NF2 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NsmfQ99NF2 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NsmfQ99NF2 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NsmfQ99NF2 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NsmfQ99NF2 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NsmfQ99NF2 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NsmfQ99NF2 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NsmfQ99NF2 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NsmfQ99NF2 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NsmfQ99NF2 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NsmfQ99NF2 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
NsmfQ99NF2 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
NsmfQ99NF2 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NsmfQ99NF2 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NsmfQ99NF2 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
NsmfQ99NF2 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
NsmfQ99NF2 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
NsmfQ99NF2 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
NsmfQ99NF2 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
NsmfQ99NF2 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
NsmfQ99NF2 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
NsmfQ99NF2 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
NsmfQ99NF2 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NsmfQ99NF2 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NsmfQ99NF2 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NsmfQ99NF2 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NsmfQ99NF2 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NsmfQ99NF2 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NsmfQ99NF2 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NsmfQ99NF2 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NsmfQ99NF2 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NsmfQ99NF2 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NsmfQ99NF2 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NsmfQ99NF2 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NsmfQ99NF2 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NsmfQ99NF2 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NsmfQ99NF2 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NsmfQ99NF2 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NsmfQ99NF2 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NsmfQ99NF2 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NsmfQ99NF2 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NsmfQ99NF2 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NsmfQ99NF2 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NsmfQ99NF2 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
NsmfQ99NF2 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NsmfQ99NF2 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NsmfQ99NF2 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
NsmfQ99NF2 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NsmfQ99NF2 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NsmfQ99NF2 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
NsmfQ99NF2 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
NsmfQ99NF2 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
NsmfQ99NF2 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
NsmfQ99NF2 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
NsmfQ99NF2 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
NsmfQ99NF2 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NsmfQ99NF2 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NsmfQ99NF2 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NsmfQ99NF2 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NsmfQ99NF2 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NsmfQ99NF2 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NsmfQ99NF2 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NsmfQ99NF2 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NsmfQ99NF2 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NsmfQ99NF2 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NsmfQ99NF2 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms