Protein–RNA interactions for Protein: Q99ME6

Atp1b4, Protein ATP1B4, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp1b4Q99ME6 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Atp1b4Q99ME6 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Atp1b4Q99ME6 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Atp1b4Q99ME6 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Atp1b4Q99ME6 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Atp1b4Q99ME6 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Atp1b4Q99ME6 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Atp1b4Q99ME6 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Atp1b4Q99ME6 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Atp1b4Q99ME6 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Atp1b4Q99ME6 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Atp1b4Q99ME6 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Atp1b4Q99ME6 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Atp1b4Q99ME6 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Atp1b4Q99ME6 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Atp1b4Q99ME6 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Atp1b4Q99ME6 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Atp1b4Q99ME6 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Atp1b4Q99ME6 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Atp1b4Q99ME6 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Atp1b4Q99ME6 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Atp1b4Q99ME6 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Atp1b4Q99ME6 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Atp1b4Q99ME6 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Atp1b4Q99ME6 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Atp1b4Q99ME6 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Atp1b4Q99ME6 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Atp1b4Q99ME6 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Atp1b4Q99ME6 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Atp1b4Q99ME6 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Atp1b4Q99ME6 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Atp1b4Q99ME6 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Atp1b4Q99ME6 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Atp1b4Q99ME6 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Atp1b4Q99ME6 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Atp1b4Q99ME6 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Atp1b4Q99ME6 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Atp1b4Q99ME6 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Atp1b4Q99ME6 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Atp1b4Q99ME6 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Atp1b4Q99ME6 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Atp1b4Q99ME6 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Atp1b4Q99ME6 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Atp1b4Q99ME6 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Atp1b4Q99ME6 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Atp1b4Q99ME6 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Atp1b4Q99ME6 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Atp1b4Q99ME6 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Atp1b4Q99ME6 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Atp1b4Q99ME6 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Atp1b4Q99ME6 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Atp1b4Q99ME6 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Atp1b4Q99ME6 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Atp1b4Q99ME6 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Atp1b4Q99ME6 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Atp1b4Q99ME6 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Atp1b4Q99ME6 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Atp1b4Q99ME6 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Atp1b4Q99ME6 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Atp1b4Q99ME6 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Atp1b4Q99ME6 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Atp1b4Q99ME6 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Atp1b4Q99ME6 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Atp1b4Q99ME6 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Atp1b4Q99ME6 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Atp1b4Q99ME6 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Atp1b4Q99ME6 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Atp1b4Q99ME6 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Atp1b4Q99ME6 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Atp1b4Q99ME6 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Atp1b4Q99ME6 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Atp1b4Q99ME6 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Atp1b4Q99ME6 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Atp1b4Q99ME6 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Atp1b4Q99ME6 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Atp1b4Q99ME6 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Atp1b4Q99ME6 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Atp1b4Q99ME6 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Atp1b4Q99ME6 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Atp1b4Q99ME6 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Atp1b4Q99ME6 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Atp1b4Q99ME6 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Atp1b4Q99ME6 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Atp1b4Q99ME6 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Atp1b4Q99ME6 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Atp1b4Q99ME6 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Atp1b4Q99ME6 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Atp1b4Q99ME6 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Atp1b4Q99ME6 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Atp1b4Q99ME6 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Atp1b4Q99ME6 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Atp1b4Q99ME6 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Atp1b4Q99ME6 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Atp1b4Q99ME6 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Atp1b4Q99ME6 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Atp1b4Q99ME6 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Atp1b4Q99ME6 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Atp1b4Q99ME6 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Atp1b4Q99ME6 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Atp1b4Q99ME6 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.3 ms