Protein–RNA interactions for Protein: Q99LG2

Tnpo2, Transportin-2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnpo2Q99LG2 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tnpo2Q99LG2 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tnpo2Q99LG2 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tnpo2Q99LG2 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tnpo2Q99LG2 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tnpo2Q99LG2 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tnpo2Q99LG2 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tnpo2Q99LG2 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tnpo2Q99LG2 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tnpo2Q99LG2 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tnpo2Q99LG2 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tnpo2Q99LG2 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tnpo2Q99LG2 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tnpo2Q99LG2 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tnpo2Q99LG2 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tnpo2Q99LG2 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tnpo2Q99LG2 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tnpo2Q99LG2 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tnpo2Q99LG2 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tnpo2Q99LG2 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tnpo2Q99LG2 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tnpo2Q99LG2 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tnpo2Q99LG2 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tnpo2Q99LG2 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tnpo2Q99LG2 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tnpo2Q99LG2 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tnpo2Q99LG2 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Tnpo2Q99LG2 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Tnpo2Q99LG2 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tnpo2Q99LG2 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tnpo2Q99LG2 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tnpo2Q99LG2 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Tnpo2Q99LG2 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tnpo2Q99LG2 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tnpo2Q99LG2 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tnpo2Q99LG2 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tnpo2Q99LG2 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tnpo2Q99LG2 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tnpo2Q99LG2 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tnpo2Q99LG2 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tnpo2Q99LG2 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tnpo2Q99LG2 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tnpo2Q99LG2 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tnpo2Q99LG2 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tnpo2Q99LG2 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tnpo2Q99LG2 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tnpo2Q99LG2 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tnpo2Q99LG2 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tnpo2Q99LG2 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tnpo2Q99LG2 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tnpo2Q99LG2 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Tnpo2Q99LG2 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tnpo2Q99LG2 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tnpo2Q99LG2 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tnpo2Q99LG2 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tnpo2Q99LG2 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tnpo2Q99LG2 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tnpo2Q99LG2 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tnpo2Q99LG2 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tnpo2Q99LG2 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Tnpo2Q99LG2 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Tnpo2Q99LG2 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Tnpo2Q99LG2 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tnpo2Q99LG2 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tnpo2Q99LG2 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Tnpo2Q99LG2 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Tnpo2Q99LG2 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tnpo2Q99LG2 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tnpo2Q99LG2 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tnpo2Q99LG2 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tnpo2Q99LG2 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Tnpo2Q99LG2 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Tnpo2Q99LG2 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tnpo2Q99LG2 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Tnpo2Q99LG2 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tnpo2Q99LG2 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Tnpo2Q99LG2 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tnpo2Q99LG2 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Tnpo2Q99LG2 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tnpo2Q99LG2 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tnpo2Q99LG2 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tnpo2Q99LG2 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tnpo2Q99LG2 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tnpo2Q99LG2 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tnpo2Q99LG2 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tnpo2Q99LG2 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tnpo2Q99LG2 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tnpo2Q99LG2 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Tnpo2Q99LG2 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tnpo2Q99LG2 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Tnpo2Q99LG2 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tnpo2Q99LG2 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tnpo2Q99LG2 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Tnpo2Q99LG2 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tnpo2Q99LG2 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tnpo2Q99LG2 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tnpo2Q99LG2 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tnpo2Q99LG2 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tnpo2Q99LG2 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tnpo2Q99LG2 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms