Protein–RNA interactions for Protein: Q99K10

Nlgn1, Neuroligin-1, mousemouse

Predictions only

Length 843 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlgn1Q99K10 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nlgn1Q99K10 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nlgn1Q99K10 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Nlgn1Q99K10 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nlgn1Q99K10 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Nlgn1Q99K10 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nlgn1Q99K10 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nlgn1Q99K10 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Nlgn1Q99K10 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Nlgn1Q99K10 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nlgn1Q99K10 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nlgn1Q99K10 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nlgn1Q99K10 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nlgn1Q99K10 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Nlgn1Q99K10 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nlgn1Q99K10 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nlgn1Q99K10 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nlgn1Q99K10 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nlgn1Q99K10 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nlgn1Q99K10 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nlgn1Q99K10 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nlgn1Q99K10 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nlgn1Q99K10 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nlgn1Q99K10 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nlgn1Q99K10 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Nlgn1Q99K10 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nlgn1Q99K10 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nlgn1Q99K10 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nlgn1Q99K10 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nlgn1Q99K10 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nlgn1Q99K10 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nlgn1Q99K10 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nlgn1Q99K10 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Nlgn1Q99K10 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nlgn1Q99K10 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nlgn1Q99K10 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nlgn1Q99K10 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nlgn1Q99K10 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nlgn1Q99K10 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nlgn1Q99K10 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nlgn1Q99K10 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nlgn1Q99K10 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Nlgn1Q99K10 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Nlgn1Q99K10 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nlgn1Q99K10 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nlgn1Q99K10 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nlgn1Q99K10 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nlgn1Q99K10 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nlgn1Q99K10 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nlgn1Q99K10 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nlgn1Q99K10 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nlgn1Q99K10 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nlgn1Q99K10 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nlgn1Q99K10 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nlgn1Q99K10 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nlgn1Q99K10 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nlgn1Q99K10 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nlgn1Q99K10 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nlgn1Q99K10 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nlgn1Q99K10 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nlgn1Q99K10 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nlgn1Q99K10 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nlgn1Q99K10 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nlgn1Q99K10 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nlgn1Q99K10 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nlgn1Q99K10 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nlgn1Q99K10 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nlgn1Q99K10 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nlgn1Q99K10 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nlgn1Q99K10 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nlgn1Q99K10 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nlgn1Q99K10 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nlgn1Q99K10 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nlgn1Q99K10 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nlgn1Q99K10 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nlgn1Q99K10 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nlgn1Q99K10 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nlgn1Q99K10 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nlgn1Q99K10 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nlgn1Q99K10 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nlgn1Q99K10 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nlgn1Q99K10 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nlgn1Q99K10 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nlgn1Q99K10 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nlgn1Q99K10 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nlgn1Q99K10 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nlgn1Q99K10 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nlgn1Q99K10 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nlgn1Q99K10 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nlgn1Q99K10 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nlgn1Q99K10 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nlgn1Q99K10 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nlgn1Q99K10 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nlgn1Q99K10 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nlgn1Q99K10 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Nlgn1Q99K10 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nlgn1Q99K10 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Nlgn1Q99K10 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nlgn1Q99K10 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nlgn1Q99K10 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms