Protein–RNA interactions for Protein: Q99JT6

Tlcd1, Calfacilitin, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlcd1Q99JT6 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tlcd1Q99JT6 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tlcd1Q99JT6 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tlcd1Q99JT6 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Tlcd1Q99JT6 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tlcd1Q99JT6 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tlcd1Q99JT6 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tlcd1Q99JT6 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tlcd1Q99JT6 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tlcd1Q99JT6 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tlcd1Q99JT6 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Tlcd1Q99JT6 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tlcd1Q99JT6 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tlcd1Q99JT6 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tlcd1Q99JT6 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tlcd1Q99JT6 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tlcd1Q99JT6 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tlcd1Q99JT6 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tlcd1Q99JT6 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tlcd1Q99JT6 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tlcd1Q99JT6 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Tlcd1Q99JT6 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tlcd1Q99JT6 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tlcd1Q99JT6 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tlcd1Q99JT6 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tlcd1Q99JT6 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tlcd1Q99JT6 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tlcd1Q99JT6 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Tlcd1Q99JT6 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tlcd1Q99JT6 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tlcd1Q99JT6 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tlcd1Q99JT6 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tlcd1Q99JT6 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tlcd1Q99JT6 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tlcd1Q99JT6 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tlcd1Q99JT6 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tlcd1Q99JT6 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tlcd1Q99JT6 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Tlcd1Q99JT6 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tlcd1Q99JT6 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tlcd1Q99JT6 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tlcd1Q99JT6 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tlcd1Q99JT6 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tlcd1Q99JT6 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tlcd1Q99JT6 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tlcd1Q99JT6 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tlcd1Q99JT6 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tlcd1Q99JT6 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tlcd1Q99JT6 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tlcd1Q99JT6 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tlcd1Q99JT6 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tlcd1Q99JT6 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tlcd1Q99JT6 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tlcd1Q99JT6 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tlcd1Q99JT6 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tlcd1Q99JT6 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Tlcd1Q99JT6 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Tlcd1Q99JT6 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tlcd1Q99JT6 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tlcd1Q99JT6 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tlcd1Q99JT6 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tlcd1Q99JT6 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tlcd1Q99JT6 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tlcd1Q99JT6 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tlcd1Q99JT6 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tlcd1Q99JT6 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tlcd1Q99JT6 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tlcd1Q99JT6 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tlcd1Q99JT6 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Tlcd1Q99JT6 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tlcd1Q99JT6 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tlcd1Q99JT6 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tlcd1Q99JT6 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tlcd1Q99JT6 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tlcd1Q99JT6 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tlcd1Q99JT6 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tlcd1Q99JT6 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tlcd1Q99JT6 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tlcd1Q99JT6 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tlcd1Q99JT6 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tlcd1Q99JT6 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Tlcd1Q99JT6 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tlcd1Q99JT6 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Tlcd1Q99JT6 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tlcd1Q99JT6 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Tlcd1Q99JT6 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tlcd1Q99JT6 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tlcd1Q99JT6 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tlcd1Q99JT6 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.02
Tlcd1Q99JT6 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tlcd1Q99JT6 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tlcd1Q99JT6 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Tlcd1Q99JT6 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tlcd1Q99JT6 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tlcd1Q99JT6 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tlcd1Q99JT6 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tlcd1Q99JT6 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tlcd1Q99JT6 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tlcd1Q99JT6 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Tlcd1Q99JT6 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms