Protein–RNA interactions for Protein: Q99JB8

Pacsin3, Protein kinase C and casein kinase II substrate protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacsin3Q99JB8 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pacsin3Q99JB8 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pacsin3Q99JB8 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pacsin3Q99JB8 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pacsin3Q99JB8 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pacsin3Q99JB8 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pacsin3Q99JB8 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pacsin3Q99JB8 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pacsin3Q99JB8 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Pacsin3Q99JB8 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Pacsin3Q99JB8 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pacsin3Q99JB8 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pacsin3Q99JB8 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pacsin3Q99JB8 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pacsin3Q99JB8 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pacsin3Q99JB8 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pacsin3Q99JB8 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pacsin3Q99JB8 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pacsin3Q99JB8 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pacsin3Q99JB8 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pacsin3Q99JB8 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pacsin3Q99JB8 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pacsin3Q99JB8 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
Pacsin3Q99JB8 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Pacsin3Q99JB8 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pacsin3Q99JB8 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pacsin3Q99JB8 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pacsin3Q99JB8 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pacsin3Q99JB8 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pacsin3Q99JB8 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pacsin3Q99JB8 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pacsin3Q99JB8 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pacsin3Q99JB8 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pacsin3Q99JB8 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pacsin3Q99JB8 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pacsin3Q99JB8 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pacsin3Q99JB8 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Pacsin3Q99JB8 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pacsin3Q99JB8 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pacsin3Q99JB8 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pacsin3Q99JB8 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pacsin3Q99JB8 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pacsin3Q99JB8 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pacsin3Q99JB8 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pacsin3Q99JB8 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pacsin3Q99JB8 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pacsin3Q99JB8 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Pacsin3Q99JB8 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pacsin3Q99JB8 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pacsin3Q99JB8 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pacsin3Q99JB8 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pacsin3Q99JB8 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pacsin3Q99JB8 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pacsin3Q99JB8 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pacsin3Q99JB8 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pacsin3Q99JB8 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pacsin3Q99JB8 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pacsin3Q99JB8 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pacsin3Q99JB8 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pacsin3Q99JB8 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pacsin3Q99JB8 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pacsin3Q99JB8 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Pacsin3Q99JB8 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pacsin3Q99JB8 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pacsin3Q99JB8 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Pacsin3Q99JB8 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pacsin3Q99JB8 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pacsin3Q99JB8 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pacsin3Q99JB8 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pacsin3Q99JB8 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Pacsin3Q99JB8 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pacsin3Q99JB8 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pacsin3Q99JB8 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pacsin3Q99JB8 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pacsin3Q99JB8 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pacsin3Q99JB8 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Pacsin3Q99JB8 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pacsin3Q99JB8 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pacsin3Q99JB8 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pacsin3Q99JB8 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pacsin3Q99JB8 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pacsin3Q99JB8 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pacsin3Q99JB8 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pacsin3Q99JB8 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pacsin3Q99JB8 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pacsin3Q99JB8 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pacsin3Q99JB8 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pacsin3Q99JB8 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pacsin3Q99JB8 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pacsin3Q99JB8 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pacsin3Q99JB8 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pacsin3Q99JB8 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pacsin3Q99JB8 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Pacsin3Q99JB8 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pacsin3Q99JB8 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pacsin3Q99JB8 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pacsin3Q99JB8 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pacsin3Q99JB8 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pacsin3Q99JB8 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Pacsin3Q99JB8 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
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