Protein–RNA interactions for Protein: Q99J10

Ctu1, Cytoplasmic tRNA 2-thiolation protein 1, mousemouse

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Length 420 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctu1Q99J10 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ctu1Q99J10 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ctu1Q99J10 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ctu1Q99J10 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ctu1Q99J10 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ctu1Q99J10 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ctu1Q99J10 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ctu1Q99J10 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ctu1Q99J10 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ctu1Q99J10 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ctu1Q99J10 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ctu1Q99J10 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ctu1Q99J10 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ctu1Q99J10 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ctu1Q99J10 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ctu1Q99J10 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ctu1Q99J10 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ctu1Q99J10 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ctu1Q99J10 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ctu1Q99J10 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ctu1Q99J10 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ctu1Q99J10 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ctu1Q99J10 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ctu1Q99J10 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ctu1Q99J10 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ctu1Q99J10 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ctu1Q99J10 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ctu1Q99J10 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ctu1Q99J10 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ctu1Q99J10 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ctu1Q99J10 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ctu1Q99J10 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ctu1Q99J10 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ctu1Q99J10 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ctu1Q99J10 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ctu1Q99J10 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ctu1Q99J10 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ctu1Q99J10 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ctu1Q99J10 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ctu1Q99J10 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ctu1Q99J10 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ctu1Q99J10 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ctu1Q99J10 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ctu1Q99J10 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ctu1Q99J10 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ctu1Q99J10 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ctu1Q99J10 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ctu1Q99J10 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ctu1Q99J10 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ctu1Q99J10 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ctu1Q99J10 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ctu1Q99J10 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ctu1Q99J10 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ctu1Q99J10 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ctu1Q99J10 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ctu1Q99J10 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
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Ctu1Q99J10 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ctu1Q99J10 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ctu1Q99J10 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ctu1Q99J10 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ctu1Q99J10 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ctu1Q99J10 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ctu1Q99J10 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ctu1Q99J10 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ctu1Q99J10 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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Ctu1Q99J10 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ctu1Q99J10 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ctu1Q99J10 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ctu1Q99J10 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ctu1Q99J10 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ctu1Q99J10 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ctu1Q99J10 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ctu1Q99J10 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ctu1Q99J10 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ctu1Q99J10 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ctu1Q99J10 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ctu1Q99J10 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ctu1Q99J10 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ctu1Q99J10 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ctu1Q99J10 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ctu1Q99J10 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ctu1Q99J10 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ctu1Q99J10 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ctu1Q99J10 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ctu1Q99J10 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ctu1Q99J10 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ctu1Q99J10 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ctu1Q99J10 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ctu1Q99J10 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ctu1Q99J10 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ctu1Q99J10 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ctu1Q99J10 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ctu1Q99J10 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ctu1Q99J10 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ctu1Q99J10 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ctu1Q99J10 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ctu1Q99J10 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ctu1Q99J10 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms