Protein–RNA interactions for Protein: Q922F4

Tubb6, Tubulin beta-6 chain, mousemouse

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb6Q922F4 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Tubb6Q922F4 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Tubb6Q922F4 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Tubb6Q922F4 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
Tubb6Q922F4 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tubb6Q922F4 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tubb6Q922F4 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tubb6Q922F4 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tubb6Q922F4 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tubb6Q922F4 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tubb6Q922F4 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Tubb6Q922F4 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tubb6Q922F4 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Tubb6Q922F4 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tubb6Q922F4 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Tubb6Q922F4 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Tubb6Q922F4 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Tubb6Q922F4 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Tubb6Q922F4 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tubb6Q922F4 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Tubb6Q922F4 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tubb6Q922F4 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tubb6Q922F4 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tubb6Q922F4 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tubb6Q922F4 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Tubb6Q922F4 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tubb6Q922F4 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tubb6Q922F4 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tubb6Q922F4 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tubb6Q922F4 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tubb6Q922F4 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tubb6Q922F4 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tubb6Q922F4 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tubb6Q922F4 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tubb6Q922F4 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tubb6Q922F4 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tubb6Q922F4 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tubb6Q922F4 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Tubb6Q922F4 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tubb6Q922F4 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tubb6Q922F4 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tubb6Q922F4 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tubb6Q922F4 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tubb6Q922F4 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tubb6Q922F4 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tubb6Q922F4 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tubb6Q922F4 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tubb6Q922F4 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tubb6Q922F4 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tubb6Q922F4 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tubb6Q922F4 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tubb6Q922F4 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tubb6Q922F4 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tubb6Q922F4 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tubb6Q922F4 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tubb6Q922F4 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tubb6Q922F4 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tubb6Q922F4 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tubb6Q922F4 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tubb6Q922F4 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tubb6Q922F4 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tubb6Q922F4 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tubb6Q922F4 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tubb6Q922F4 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tubb6Q922F4 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tubb6Q922F4 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tubb6Q922F4 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tubb6Q922F4 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tubb6Q922F4 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tubb6Q922F4 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Tubb6Q922F4 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Tubb6Q922F4 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tubb6Q922F4 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Tubb6Q922F4 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tubb6Q922F4 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tubb6Q922F4 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tubb6Q922F4 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tubb6Q922F4 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tubb6Q922F4 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tubb6Q922F4 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tubb6Q922F4 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tubb6Q922F4 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tubb6Q922F4 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tubb6Q922F4 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tubb6Q922F4 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tubb6Q922F4 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tubb6Q922F4 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tubb6Q922F4 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tubb6Q922F4 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tubb6Q922F4 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tubb6Q922F4 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tubb6Q922F4 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tubb6Q922F4 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tubb6Q922F4 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tubb6Q922F4 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tubb6Q922F4 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tubb6Q922F4 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tubb6Q922F4 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tubb6Q922F4 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tubb6Q922F4 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms