Protein–RNA interactions for Protein: Q91VE6

Nifk, MKI67 FHA domain-interacting nucleolar phosphoprotein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 317 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NifkQ91VE6 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
NifkQ91VE6 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
NifkQ91VE6 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
NifkQ91VE6 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
NifkQ91VE6 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
NifkQ91VE6 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
NifkQ91VE6 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
NifkQ91VE6 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
NifkQ91VE6 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
NifkQ91VE6 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
NifkQ91VE6 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
NifkQ91VE6 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
NifkQ91VE6 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
NifkQ91VE6 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
NifkQ91VE6 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
NifkQ91VE6 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
NifkQ91VE6 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
NifkQ91VE6 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
NifkQ91VE6 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
NifkQ91VE6 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
NifkQ91VE6 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
NifkQ91VE6 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
NifkQ91VE6 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
NifkQ91VE6 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
NifkQ91VE6 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
NifkQ91VE6 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
NifkQ91VE6 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
NifkQ91VE6 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
NifkQ91VE6 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
NifkQ91VE6 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
NifkQ91VE6 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
NifkQ91VE6 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
NifkQ91VE6 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
NifkQ91VE6 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
NifkQ91VE6 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
NifkQ91VE6 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
NifkQ91VE6 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
NifkQ91VE6 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
NifkQ91VE6 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
NifkQ91VE6 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
NifkQ91VE6 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
NifkQ91VE6 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
NifkQ91VE6 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
NifkQ91VE6 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
NifkQ91VE6 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
NifkQ91VE6 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
NifkQ91VE6 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NifkQ91VE6 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NifkQ91VE6 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NifkQ91VE6 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
NifkQ91VE6 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
NifkQ91VE6 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
NifkQ91VE6 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NifkQ91VE6 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NifkQ91VE6 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NifkQ91VE6 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NifkQ91VE6 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NifkQ91VE6 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NifkQ91VE6 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
NifkQ91VE6 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
NifkQ91VE6 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
NifkQ91VE6 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NifkQ91VE6 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NifkQ91VE6 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NifkQ91VE6 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
NifkQ91VE6 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NifkQ91VE6 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NifkQ91VE6 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
NifkQ91VE6 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
NifkQ91VE6 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NifkQ91VE6 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NifkQ91VE6 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
NifkQ91VE6 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
NifkQ91VE6 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NifkQ91VE6 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NifkQ91VE6 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NifkQ91VE6 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NifkQ91VE6 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
NifkQ91VE6 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NifkQ91VE6 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NifkQ91VE6 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NifkQ91VE6 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NifkQ91VE6 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NifkQ91VE6 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
NifkQ91VE6 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NifkQ91VE6 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NifkQ91VE6 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NifkQ91VE6 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NifkQ91VE6 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NifkQ91VE6 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
NifkQ91VE6 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
NifkQ91VE6 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NifkQ91VE6 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
NifkQ91VE6 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
NifkQ91VE6 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
NifkQ91VE6 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
NifkQ91VE6 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
NifkQ91VE6 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
NifkQ91VE6 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NifkQ91VE6 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.8 ms