Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDB9

Slc6a20a, Sodium- and chloride-dependent transporter XTRP3A, mousemouse

Predictions only

Length 592 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc6a20aQ8VDB9 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Slc6a20aQ8VDB9 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Slc6a20aQ8VDB9 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Slc6a20aQ8VDB9 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Slc6a20aQ8VDB9 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Slc6a20aQ8VDB9 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Slc6a20aQ8VDB9 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Slc6a20aQ8VDB9 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Slc6a20aQ8VDB9 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Slc6a20aQ8VDB9 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Slc6a20aQ8VDB9 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Slc6a20aQ8VDB9 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Slc6a20aQ8VDB9 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Slc6a20aQ8VDB9 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Slc6a20aQ8VDB9 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Slc6a20aQ8VDB9 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Slc6a20aQ8VDB9 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Slc6a20aQ8VDB9 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Slc6a20aQ8VDB9 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Slc6a20aQ8VDB9 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Slc6a20aQ8VDB9 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Slc6a20aQ8VDB9 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Slc6a20aQ8VDB9 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Slc6a20aQ8VDB9 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Slc6a20aQ8VDB9 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Slc6a20aQ8VDB9 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Slc6a20aQ8VDB9 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Slc6a20aQ8VDB9 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Slc6a20aQ8VDB9 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Slc6a20aQ8VDB9 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Slc6a20aQ8VDB9 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Slc6a20aQ8VDB9 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Slc6a20aQ8VDB9 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Slc6a20aQ8VDB9 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Slc6a20aQ8VDB9 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Slc6a20aQ8VDB9 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Slc6a20aQ8VDB9 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Slc6a20aQ8VDB9 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Slc6a20aQ8VDB9 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Slc6a20aQ8VDB9 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Slc6a20aQ8VDB9 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Slc6a20aQ8VDB9 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Slc6a20aQ8VDB9 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Slc6a20aQ8VDB9 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Slc6a20aQ8VDB9 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Slc6a20aQ8VDB9 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Slc6a20aQ8VDB9 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Slc6a20aQ8VDB9 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Slc6a20aQ8VDB9 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Slc6a20aQ8VDB9 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Slc6a20aQ8VDB9 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Slc6a20aQ8VDB9 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Slc6a20aQ8VDB9 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Slc6a20aQ8VDB9 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Slc6a20aQ8VDB9 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Slc6a20aQ8VDB9 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Slc6a20aQ8VDB9 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Slc6a20aQ8VDB9 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Slc6a20aQ8VDB9 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Slc6a20aQ8VDB9 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Slc6a20aQ8VDB9 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Slc6a20aQ8VDB9 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Slc6a20aQ8VDB9 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Slc6a20aQ8VDB9 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Slc6a20aQ8VDB9 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Slc6a20aQ8VDB9 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Slc6a20aQ8VDB9 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Slc6a20aQ8VDB9 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Slc6a20aQ8VDB9 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Slc6a20aQ8VDB9 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Slc6a20aQ8VDB9 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Slc6a20aQ8VDB9 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Slc6a20aQ8VDB9 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Slc6a20aQ8VDB9 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Slc6a20aQ8VDB9 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Slc6a20aQ8VDB9 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Slc6a20aQ8VDB9 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Slc6a20aQ8VDB9 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Slc6a20aQ8VDB9 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Slc6a20aQ8VDB9 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Slc6a20aQ8VDB9 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Slc6a20aQ8VDB9 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Slc6a20aQ8VDB9 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Slc6a20aQ8VDB9 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Slc6a20aQ8VDB9 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Slc6a20aQ8VDB9 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Slc6a20aQ8VDB9 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Slc6a20aQ8VDB9 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Slc6a20aQ8VDB9 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Slc6a20aQ8VDB9 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Slc6a20aQ8VDB9 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Slc6a20aQ8VDB9 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Slc6a20aQ8VDB9 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Slc6a20aQ8VDB9 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Slc6a20aQ8VDB9 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Slc6a20aQ8VDB9 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Slc6a20aQ8VDB9 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Slc6a20aQ8VDB9 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Slc6a20aQ8VDB9 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Slc6a20aQ8VDB9 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
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