Protein–RNA interactions for Protein: Q8R344

Ccdc12, Coiled-coil domain-containing protein 12, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc12Q8R344 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc12Q8R344 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc12Q8R344 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc12Q8R344 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc12Q8R344 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc12Q8R344 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc12Q8R344 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc12Q8R344 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc12Q8R344 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc12Q8R344 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc12Q8R344 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc12Q8R344 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc12Q8R344 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc12Q8R344 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc12Q8R344 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc12Q8R344 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc12Q8R344 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc12Q8R344 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc12Q8R344 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc12Q8R344 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc12Q8R344 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc12Q8R344 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc12Q8R344 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc12Q8R344 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc12Q8R344 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc12Q8R344 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc12Q8R344 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc12Q8R344 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc12Q8R344 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc12Q8R344 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc12Q8R344 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc12Q8R344 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc12Q8R344 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc12Q8R344 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc12Q8R344 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc12Q8R344 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc12Q8R344 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc12Q8R344 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc12Q8R344 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc12Q8R344 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc12Q8R344 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc12Q8R344 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc12Q8R344 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc12Q8R344 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc12Q8R344 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc12Q8R344 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc12Q8R344 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc12Q8R344 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc12Q8R344 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc12Q8R344 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc12Q8R344 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc12Q8R344 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc12Q8R344 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc12Q8R344 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc12Q8R344 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc12Q8R344 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc12Q8R344 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc12Q8R344 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc12Q8R344 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc12Q8R344 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc12Q8R344 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc12Q8R344 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc12Q8R344 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc12Q8R344 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc12Q8R344 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc12Q8R344 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc12Q8R344 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc12Q8R344 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc12Q8R344 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc12Q8R344 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc12Q8R344 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc12Q8R344 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc12Q8R344 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc12Q8R344 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc12Q8R344 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc12Q8R344 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc12Q8R344 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc12Q8R344 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc12Q8R344 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc12Q8R344 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc12Q8R344 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc12Q8R344 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc12Q8R344 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc12Q8R344 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc12Q8R344 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc12Q8R344 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc12Q8R344 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc12Q8R344 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc12Q8R344 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc12Q8R344 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc12Q8R344 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc12Q8R344 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc12Q8R344 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc12Q8R344 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc12Q8R344 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc12Q8R344 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc12Q8R344 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc12Q8R344 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc12Q8R344 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc12Q8R344 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.2 ms