Protein–RNA interactions for Protein: Q8R332

Nup58, Nucleoporin p58/p45, mousemouse

Predictions only

Length 587 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup58Q8R332 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nup58Q8R332 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nup58Q8R332 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nup58Q8R332 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nup58Q8R332 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nup58Q8R332 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Nup58Q8R332 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nup58Q8R332 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nup58Q8R332 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nup58Q8R332 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Nup58Q8R332 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Nup58Q8R332 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nup58Q8R332 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nup58Q8R332 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nup58Q8R332 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nup58Q8R332 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nup58Q8R332 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nup58Q8R332 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nup58Q8R332 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nup58Q8R332 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nup58Q8R332 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nup58Q8R332 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nup58Q8R332 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nup58Q8R332 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Nup58Q8R332 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Nup58Q8R332 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nup58Q8R332 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nup58Q8R332 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nup58Q8R332 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Nup58Q8R332 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Nup58Q8R332 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nup58Q8R332 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nup58Q8R332 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nup58Q8R332 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nup58Q8R332 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nup58Q8R332 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nup58Q8R332 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nup58Q8R332 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nup58Q8R332 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nup58Q8R332 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nup58Q8R332 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nup58Q8R332 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nup58Q8R332 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nup58Q8R332 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nup58Q8R332 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nup58Q8R332 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nup58Q8R332 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nup58Q8R332 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nup58Q8R332 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nup58Q8R332 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nup58Q8R332 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Nup58Q8R332 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Nup58Q8R332 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nup58Q8R332 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Nup58Q8R332 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Nup58Q8R332 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nup58Q8R332 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nup58Q8R332 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nup58Q8R332 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Nup58Q8R332 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nup58Q8R332 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nup58Q8R332 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nup58Q8R332 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nup58Q8R332 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Nup58Q8R332 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nup58Q8R332 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nup58Q8R332 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nup58Q8R332 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nup58Q8R332 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nup58Q8R332 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nup58Q8R332 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nup58Q8R332 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nup58Q8R332 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nup58Q8R332 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nup58Q8R332 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nup58Q8R332 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Nup58Q8R332 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nup58Q8R332 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nup58Q8R332 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nup58Q8R332 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nup58Q8R332 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nup58Q8R332 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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