Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3K8

Optn, Optineurin, mousemouse

Predictions only

Length 584 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OptnQ8K3K8 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
OptnQ8K3K8 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
OptnQ8K3K8 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
OptnQ8K3K8 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC18■□□□□ 0.47
OptnQ8K3K8 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
OptnQ8K3K8 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
OptnQ8K3K8 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
OptnQ8K3K8 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
OptnQ8K3K8 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
OptnQ8K3K8 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
OptnQ8K3K8 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
OptnQ8K3K8 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
OptnQ8K3K8 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
OptnQ8K3K8 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
OptnQ8K3K8 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
OptnQ8K3K8 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
OptnQ8K3K8 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
OptnQ8K3K8 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
OptnQ8K3K8 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
OptnQ8K3K8 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
OptnQ8K3K8 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
OptnQ8K3K8 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
OptnQ8K3K8 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
OptnQ8K3K8 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
OptnQ8K3K8 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
OptnQ8K3K8 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
OptnQ8K3K8 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
OptnQ8K3K8 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
OptnQ8K3K8 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
OptnQ8K3K8 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
OptnQ8K3K8 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
OptnQ8K3K8 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
OptnQ8K3K8 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
OptnQ8K3K8 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
OptnQ8K3K8 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
OptnQ8K3K8 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
OptnQ8K3K8 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
OptnQ8K3K8 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
OptnQ8K3K8 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
OptnQ8K3K8 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
OptnQ8K3K8 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
OptnQ8K3K8 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
OptnQ8K3K8 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
OptnQ8K3K8 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
OptnQ8K3K8 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
OptnQ8K3K8 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
OptnQ8K3K8 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
OptnQ8K3K8 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
OptnQ8K3K8 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
OptnQ8K3K8 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
OptnQ8K3K8 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
OptnQ8K3K8 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
OptnQ8K3K8 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
OptnQ8K3K8 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
OptnQ8K3K8 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
OptnQ8K3K8 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
OptnQ8K3K8 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
OptnQ8K3K8 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
OptnQ8K3K8 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
OptnQ8K3K8 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
OptnQ8K3K8 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
OptnQ8K3K8 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
OptnQ8K3K8 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
OptnQ8K3K8 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
OptnQ8K3K8 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
OptnQ8K3K8 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
OptnQ8K3K8 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
OptnQ8K3K8 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
OptnQ8K3K8 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
OptnQ8K3K8 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
OptnQ8K3K8 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
OptnQ8K3K8 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
OptnQ8K3K8 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
OptnQ8K3K8 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
OptnQ8K3K8 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
OptnQ8K3K8 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
OptnQ8K3K8 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
OptnQ8K3K8 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
OptnQ8K3K8 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
OptnQ8K3K8 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
OptnQ8K3K8 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
OptnQ8K3K8 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
OptnQ8K3K8 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
OptnQ8K3K8 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
OptnQ8K3K8 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
OptnQ8K3K8 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
OptnQ8K3K8 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
OptnQ8K3K8 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
OptnQ8K3K8 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
OptnQ8K3K8 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
OptnQ8K3K8 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
OptnQ8K3K8 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
OptnQ8K3K8 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
OptnQ8K3K8 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
OptnQ8K3K8 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
OptnQ8K3K8 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
OptnQ8K3K8 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
OptnQ8K3K8 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
OptnQ8K3K8 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
OptnQ8K3K8 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 169.4 ms