Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2L8

Trappc12, Trafficking protein particle complex subunit 12, mousemouse

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc12Q8K2L8 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Trappc12Q8K2L8 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Trappc12Q8K2L8 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Trappc12Q8K2L8 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Trappc12Q8K2L8 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trappc12Q8K2L8 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trappc12Q8K2L8 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trappc12Q8K2L8 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trappc12Q8K2L8 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trappc12Q8K2L8 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trappc12Q8K2L8 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trappc12Q8K2L8 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trappc12Q8K2L8 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Trappc12Q8K2L8 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Trappc12Q8K2L8 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trappc12Q8K2L8 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Trappc12Q8K2L8 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trappc12Q8K2L8 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trappc12Q8K2L8 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trappc12Q8K2L8 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Trappc12Q8K2L8 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trappc12Q8K2L8 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trappc12Q8K2L8 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trappc12Q8K2L8 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trappc12Q8K2L8 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trappc12Q8K2L8 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trappc12Q8K2L8 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trappc12Q8K2L8 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trappc12Q8K2L8 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trappc12Q8K2L8 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trappc12Q8K2L8 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trappc12Q8K2L8 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trappc12Q8K2L8 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trappc12Q8K2L8 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trappc12Q8K2L8 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trappc12Q8K2L8 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trappc12Q8K2L8 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trappc12Q8K2L8 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trappc12Q8K2L8 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Trappc12Q8K2L8 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trappc12Q8K2L8 Gm35409-201ENSMUST00000196412 1102 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trappc12Q8K2L8 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Trappc12Q8K2L8 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trappc12Q8K2L8 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trappc12Q8K2L8 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trappc12Q8K2L8 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trappc12Q8K2L8 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trappc12Q8K2L8 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trappc12Q8K2L8 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trappc12Q8K2L8 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trappc12Q8K2L8 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trappc12Q8K2L8 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trappc12Q8K2L8 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trappc12Q8K2L8 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trappc12Q8K2L8 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trappc12Q8K2L8 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trappc12Q8K2L8 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trappc12Q8K2L8 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trappc12Q8K2L8 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trappc12Q8K2L8 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trappc12Q8K2L8 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trappc12Q8K2L8 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trappc12Q8K2L8 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trappc12Q8K2L8 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trappc12Q8K2L8 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trappc12Q8K2L8 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trappc12Q8K2L8 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trappc12Q8K2L8 Gm37466-201ENSMUST00000195692 652 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Trappc12Q8K2L8 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trappc12Q8K2L8 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Trappc12Q8K2L8 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trappc12Q8K2L8 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trappc12Q8K2L8 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trappc12Q8K2L8 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Trappc12Q8K2L8 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Trappc12Q8K2L8 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trappc12Q8K2L8 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trappc12Q8K2L8 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trappc12Q8K2L8 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trappc12Q8K2L8 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trappc12Q8K2L8 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trappc12Q8K2L8 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trappc12Q8K2L8 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trappc12Q8K2L8 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trappc12Q8K2L8 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trappc12Q8K2L8 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trappc12Q8K2L8 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trappc12Q8K2L8 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Trappc12Q8K2L8 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trappc12Q8K2L8 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trappc12Q8K2L8 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trappc12Q8K2L8 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Trappc12Q8K2L8 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Trappc12Q8K2L8 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Trappc12Q8K2L8 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trappc12Q8K2L8 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Trappc12Q8K2L8 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Trappc12Q8K2L8 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Trappc12Q8K2L8 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Trappc12Q8K2L8 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms