Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2F0

Brd3, Bromodomain-containing protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 726 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd3Q8K2F0 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Brd3Q8K2F0 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Brd3Q8K2F0 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Brd3Q8K2F0 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Brd3Q8K2F0 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Brd3Q8K2F0 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Brd3Q8K2F0 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Brd3Q8K2F0 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Brd3Q8K2F0 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Brd3Q8K2F0 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Brd3Q8K2F0 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Brd3Q8K2F0 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Brd3Q8K2F0 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Brd3Q8K2F0 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Brd3Q8K2F0 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Brd3Q8K2F0 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Brd3Q8K2F0 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Brd3Q8K2F0 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Brd3Q8K2F0 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Brd3Q8K2F0 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Brd3Q8K2F0 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Brd3Q8K2F0 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Brd3Q8K2F0 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Brd3Q8K2F0 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Brd3Q8K2F0 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Brd3Q8K2F0 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Brd3Q8K2F0 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Brd3Q8K2F0 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Brd3Q8K2F0 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Brd3Q8K2F0 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Brd3Q8K2F0 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Brd3Q8K2F0 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Brd3Q8K2F0 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Brd3Q8K2F0 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Brd3Q8K2F0 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Brd3Q8K2F0 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Brd3Q8K2F0 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Brd3Q8K2F0 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Brd3Q8K2F0 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Brd3Q8K2F0 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Brd3Q8K2F0 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Brd3Q8K2F0 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Brd3Q8K2F0 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Brd3Q8K2F0 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Brd3Q8K2F0 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Brd3Q8K2F0 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Brd3Q8K2F0 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Brd3Q8K2F0 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Brd3Q8K2F0 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Brd3Q8K2F0 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Brd3Q8K2F0 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Brd3Q8K2F0 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Brd3Q8K2F0 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Brd3Q8K2F0 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Brd3Q8K2F0 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Brd3Q8K2F0 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Brd3Q8K2F0 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Brd3Q8K2F0 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Brd3Q8K2F0 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Brd3Q8K2F0 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Brd3Q8K2F0 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Brd3Q8K2F0 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Brd3Q8K2F0 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Brd3Q8K2F0 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Brd3Q8K2F0 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Brd3Q8K2F0 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Brd3Q8K2F0 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Brd3Q8K2F0 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Brd3Q8K2F0 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Brd3Q8K2F0 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Brd3Q8K2F0 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Brd3Q8K2F0 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Brd3Q8K2F0 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Brd3Q8K2F0 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Brd3Q8K2F0 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Brd3Q8K2F0 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Brd3Q8K2F0 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Brd3Q8K2F0 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Brd3Q8K2F0 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Brd3Q8K2F0 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Brd3Q8K2F0 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Brd3Q8K2F0 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Brd3Q8K2F0 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Brd3Q8K2F0 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Brd3Q8K2F0 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Brd3Q8K2F0 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Brd3Q8K2F0 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Brd3Q8K2F0 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Brd3Q8K2F0 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Brd3Q8K2F0 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Brd3Q8K2F0 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Brd3Q8K2F0 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Brd3Q8K2F0 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Brd3Q8K2F0 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Brd3Q8K2F0 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Brd3Q8K2F0 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Brd3Q8K2F0 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Brd3Q8K2F0 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Brd3Q8K2F0 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Brd3Q8K2F0 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11 ms