Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIK8

Rfwd3, E3 ubiquitin-protein ligase RFWD3, mousemouse

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Length 774 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfwd3Q8CIK8 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rfwd3Q8CIK8 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rfwd3Q8CIK8 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rfwd3Q8CIK8 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rfwd3Q8CIK8 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rfwd3Q8CIK8 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rfwd3Q8CIK8 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rfwd3Q8CIK8 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rfwd3Q8CIK8 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rfwd3Q8CIK8 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rfwd3Q8CIK8 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rfwd3Q8CIK8 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rfwd3Q8CIK8 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rfwd3Q8CIK8 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rfwd3Q8CIK8 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rfwd3Q8CIK8 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rfwd3Q8CIK8 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Rfwd3Q8CIK8 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rfwd3Q8CIK8 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rfwd3Q8CIK8 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rfwd3Q8CIK8 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rfwd3Q8CIK8 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rfwd3Q8CIK8 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rfwd3Q8CIK8 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rfwd3Q8CIK8 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rfwd3Q8CIK8 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rfwd3Q8CIK8 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rfwd3Q8CIK8 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rfwd3Q8CIK8 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rfwd3Q8CIK8 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rfwd3Q8CIK8 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rfwd3Q8CIK8 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rfwd3Q8CIK8 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rfwd3Q8CIK8 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rfwd3Q8CIK8 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rfwd3Q8CIK8 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rfwd3Q8CIK8 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rfwd3Q8CIK8 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Rfwd3Q8CIK8 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rfwd3Q8CIK8 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rfwd3Q8CIK8 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rfwd3Q8CIK8 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rfwd3Q8CIK8 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rfwd3Q8CIK8 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rfwd3Q8CIK8 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rfwd3Q8CIK8 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rfwd3Q8CIK8 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rfwd3Q8CIK8 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rfwd3Q8CIK8 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rfwd3Q8CIK8 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rfwd3Q8CIK8 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rfwd3Q8CIK8 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rfwd3Q8CIK8 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rfwd3Q8CIK8 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rfwd3Q8CIK8 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rfwd3Q8CIK8 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rfwd3Q8CIK8 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rfwd3Q8CIK8 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rfwd3Q8CIK8 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rfwd3Q8CIK8 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rfwd3Q8CIK8 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rfwd3Q8CIK8 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rfwd3Q8CIK8 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rfwd3Q8CIK8 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rfwd3Q8CIK8 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rfwd3Q8CIK8 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rfwd3Q8CIK8 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rfwd3Q8CIK8 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rfwd3Q8CIK8 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rfwd3Q8CIK8 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rfwd3Q8CIK8 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rfwd3Q8CIK8 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rfwd3Q8CIK8 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rfwd3Q8CIK8 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rfwd3Q8CIK8 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rfwd3Q8CIK8 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rfwd3Q8CIK8 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rfwd3Q8CIK8 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rfwd3Q8CIK8 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rfwd3Q8CIK8 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rfwd3Q8CIK8 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Rfwd3Q8CIK8 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Rfwd3Q8CIK8 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rfwd3Q8CIK8 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Rfwd3Q8CIK8 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rfwd3Q8CIK8 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Rfwd3Q8CIK8 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rfwd3Q8CIK8 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rfwd3Q8CIK8 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rfwd3Q8CIK8 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Rfwd3Q8CIK8 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rfwd3Q8CIK8 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Rfwd3Q8CIK8 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Rfwd3Q8CIK8 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rfwd3Q8CIK8 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rfwd3Q8CIK8 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rfwd3Q8CIK8 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rfwd3Q8CIK8 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rfwd3Q8CIK8 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rfwd3Q8CIK8 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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