Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGI1

Fam193a, Protein FAM193A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,231 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam193aQ8CGI1 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fam193aQ8CGI1 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fam193aQ8CGI1 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fam193aQ8CGI1 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Fam193aQ8CGI1 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Fam193aQ8CGI1 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fam193aQ8CGI1 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fam193aQ8CGI1 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fam193aQ8CGI1 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fam193aQ8CGI1 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Fam193aQ8CGI1 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fam193aQ8CGI1 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Fam193aQ8CGI1 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Fam193aQ8CGI1 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fam193aQ8CGI1 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fam193aQ8CGI1 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fam193aQ8CGI1 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fam193aQ8CGI1 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Fam193aQ8CGI1 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fam193aQ8CGI1 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fam193aQ8CGI1 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fam193aQ8CGI1 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fam193aQ8CGI1 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fam193aQ8CGI1 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fam193aQ8CGI1 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fam193aQ8CGI1 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fam193aQ8CGI1 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fam193aQ8CGI1 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fam193aQ8CGI1 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fam193aQ8CGI1 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fam193aQ8CGI1 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fam193aQ8CGI1 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fam193aQ8CGI1 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fam193aQ8CGI1 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fam193aQ8CGI1 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fam193aQ8CGI1 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Fam193aQ8CGI1 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fam193aQ8CGI1 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fam193aQ8CGI1 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Fam193aQ8CGI1 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fam193aQ8CGI1 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fam193aQ8CGI1 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fam193aQ8CGI1 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fam193aQ8CGI1 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fam193aQ8CGI1 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fam193aQ8CGI1 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fam193aQ8CGI1 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fam193aQ8CGI1 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fam193aQ8CGI1 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fam193aQ8CGI1 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fam193aQ8CGI1 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fam193aQ8CGI1 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fam193aQ8CGI1 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fam193aQ8CGI1 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fam193aQ8CGI1 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fam193aQ8CGI1 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Fam193aQ8CGI1 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Fam193aQ8CGI1 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fam193aQ8CGI1 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fam193aQ8CGI1 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fam193aQ8CGI1 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fam193aQ8CGI1 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fam193aQ8CGI1 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fam193aQ8CGI1 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fam193aQ8CGI1 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fam193aQ8CGI1 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fam193aQ8CGI1 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fam193aQ8CGI1 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fam193aQ8CGI1 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fam193aQ8CGI1 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fam193aQ8CGI1 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fam193aQ8CGI1 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fam193aQ8CGI1 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fam193aQ8CGI1 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fam193aQ8CGI1 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fam193aQ8CGI1 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fam193aQ8CGI1 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fam193aQ8CGI1 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fam193aQ8CGI1 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fam193aQ8CGI1 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fam193aQ8CGI1 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fam193aQ8CGI1 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fam193aQ8CGI1 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fam193aQ8CGI1 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fam193aQ8CGI1 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fam193aQ8CGI1 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fam193aQ8CGI1 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fam193aQ8CGI1 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fam193aQ8CGI1 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Fam193aQ8CGI1 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Fam193aQ8CGI1 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fam193aQ8CGI1 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fam193aQ8CGI1 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fam193aQ8CGI1 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fam193aQ8CGI1 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fam193aQ8CGI1 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fam193aQ8CGI1 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fam193aQ8CGI1 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fam193aQ8CGI1 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fam193aQ8CGI1 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.5 ms