Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGC6

Rbm28, RNA-binding protein 28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 750 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm28Q8CGC6 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rbm28Q8CGC6 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rbm28Q8CGC6 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rbm28Q8CGC6 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rbm28Q8CGC6 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rbm28Q8CGC6 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rbm28Q8CGC6 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rbm28Q8CGC6 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rbm28Q8CGC6 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rbm28Q8CGC6 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rbm28Q8CGC6 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rbm28Q8CGC6 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rbm28Q8CGC6 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rbm28Q8CGC6 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rbm28Q8CGC6 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rbm28Q8CGC6 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rbm28Q8CGC6 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rbm28Q8CGC6 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rbm28Q8CGC6 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rbm28Q8CGC6 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Rbm28Q8CGC6 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rbm28Q8CGC6 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Rbm28Q8CGC6 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rbm28Q8CGC6 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rbm28Q8CGC6 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Rbm28Q8CGC6 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rbm28Q8CGC6 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rbm28Q8CGC6 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rbm28Q8CGC6 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rbm28Q8CGC6 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rbm28Q8CGC6 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Rbm28Q8CGC6 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rbm28Q8CGC6 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rbm28Q8CGC6 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rbm28Q8CGC6 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rbm28Q8CGC6 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rbm28Q8CGC6 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rbm28Q8CGC6 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rbm28Q8CGC6 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rbm28Q8CGC6 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Rbm28Q8CGC6 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rbm28Q8CGC6 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rbm28Q8CGC6 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rbm28Q8CGC6 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rbm28Q8CGC6 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rbm28Q8CGC6 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rbm28Q8CGC6 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rbm28Q8CGC6 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rbm28Q8CGC6 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rbm28Q8CGC6 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Rbm28Q8CGC6 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rbm28Q8CGC6 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Rbm28Q8CGC6 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rbm28Q8CGC6 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rbm28Q8CGC6 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rbm28Q8CGC6 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
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Rbm28Q8CGC6 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rbm28Q8CGC6 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rbm28Q8CGC6 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rbm28Q8CGC6 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rbm28Q8CGC6 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
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Rbm28Q8CGC6 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Rbm28Q8CGC6 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Rbm28Q8CGC6 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Rbm28Q8CGC6 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
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Rbm28Q8CGC6 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rbm28Q8CGC6 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rbm28Q8CGC6 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rbm28Q8CGC6 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rbm28Q8CGC6 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rbm28Q8CGC6 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rbm28Q8CGC6 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rbm28Q8CGC6 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rbm28Q8CGC6 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rbm28Q8CGC6 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rbm28Q8CGC6 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rbm28Q8CGC6 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rbm28Q8CGC6 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Rbm28Q8CGC6 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Rbm28Q8CGC6 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Rbm28Q8CGC6 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rbm28Q8CGC6 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Rbm28Q8CGC6 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rbm28Q8CGC6 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rbm28Q8CGC6 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rbm28Q8CGC6 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rbm28Q8CGC6 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rbm28Q8CGC6 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rbm28Q8CGC6 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rbm28Q8CGC6 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rbm28Q8CGC6 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rbm28Q8CGC6 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rbm28Q8CGC6 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rbm28Q8CGC6 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
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