Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFE8

Fbxw17, F-box and WD-40 domain protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 466 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxw17Q8CFE8 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Fbxw17Q8CFE8 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Fbxw17Q8CFE8 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Fbxw17Q8CFE8 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Fbxw17Q8CFE8 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Fbxw17Q8CFE8 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Fbxw17Q8CFE8 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Fbxw17Q8CFE8 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Fbxw17Q8CFE8 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Fbxw17Q8CFE8 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Fbxw17Q8CFE8 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Fbxw17Q8CFE8 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Fbxw17Q8CFE8 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Fbxw17Q8CFE8 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Fbxw17Q8CFE8 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Fbxw17Q8CFE8 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Fbxw17Q8CFE8 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Fbxw17Q8CFE8 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Fbxw17Q8CFE8 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Fbxw17Q8CFE8 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Fbxw17Q8CFE8 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Fbxw17Q8CFE8 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Fbxw17Q8CFE8 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Fbxw17Q8CFE8 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Fbxw17Q8CFE8 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Fbxw17Q8CFE8 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Fbxw17Q8CFE8 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Fbxw17Q8CFE8 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Fbxw17Q8CFE8 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Fbxw17Q8CFE8 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Fbxw17Q8CFE8 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Fbxw17Q8CFE8 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Fbxw17Q8CFE8 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Fbxw17Q8CFE8 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Fbxw17Q8CFE8 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Fbxw17Q8CFE8 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Fbxw17Q8CFE8 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Fbxw17Q8CFE8 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Fbxw17Q8CFE8 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Fbxw17Q8CFE8 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Fbxw17Q8CFE8 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Fbxw17Q8CFE8 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Fbxw17Q8CFE8 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Fbxw17Q8CFE8 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Fbxw17Q8CFE8 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Fbxw17Q8CFE8 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Fbxw17Q8CFE8 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Fbxw17Q8CFE8 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Fbxw17Q8CFE8 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Fbxw17Q8CFE8 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Fbxw17Q8CFE8 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Fbxw17Q8CFE8 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Fbxw17Q8CFE8 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Fbxw17Q8CFE8 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Fbxw17Q8CFE8 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Fbxw17Q8CFE8 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Fbxw17Q8CFE8 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Fbxw17Q8CFE8 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Fbxw17Q8CFE8 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Fbxw17Q8CFE8 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Fbxw17Q8CFE8 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
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Fbxw17Q8CFE8 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Fbxw17Q8CFE8 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Fbxw17Q8CFE8 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Fbxw17Q8CFE8 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Fbxw17Q8CFE8 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Fbxw17Q8CFE8 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Fbxw17Q8CFE8 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Fbxw17Q8CFE8 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Fbxw17Q8CFE8 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Fbxw17Q8CFE8 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Fbxw17Q8CFE8 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Fbxw17Q8CFE8 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Fbxw17Q8CFE8 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Fbxw17Q8CFE8 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Fbxw17Q8CFE8 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Fbxw17Q8CFE8 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Fbxw17Q8CFE8 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Fbxw17Q8CFE8 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Fbxw17Q8CFE8 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Fbxw17Q8CFE8 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Fbxw17Q8CFE8 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Fbxw17Q8CFE8 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Fbxw17Q8CFE8 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Fbxw17Q8CFE8 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Fbxw17Q8CFE8 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Fbxw17Q8CFE8 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Fbxw17Q8CFE8 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Fbxw17Q8CFE8 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Fbxw17Q8CFE8 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Fbxw17Q8CFE8 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms