Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD4

Snx8, Sorting nexin-8, mousemouse

Predictions only

Length 459 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx8Q8CFD4 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Snx8Q8CFD4 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Snx8Q8CFD4 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Snx8Q8CFD4 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Snx8Q8CFD4 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Snx8Q8CFD4 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Snx8Q8CFD4 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Snx8Q8CFD4 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Snx8Q8CFD4 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Snx8Q8CFD4 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Snx8Q8CFD4 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Snx8Q8CFD4 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Snx8Q8CFD4 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Snx8Q8CFD4 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Snx8Q8CFD4 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Snx8Q8CFD4 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Snx8Q8CFD4 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Snx8Q8CFD4 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Snx8Q8CFD4 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Snx8Q8CFD4 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Snx8Q8CFD4 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Snx8Q8CFD4 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Snx8Q8CFD4 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Snx8Q8CFD4 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Snx8Q8CFD4 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Snx8Q8CFD4 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Snx8Q8CFD4 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Snx8Q8CFD4 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Snx8Q8CFD4 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Snx8Q8CFD4 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Snx8Q8CFD4 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Snx8Q8CFD4 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Snx8Q8CFD4 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Snx8Q8CFD4 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Snx8Q8CFD4 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Snx8Q8CFD4 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Snx8Q8CFD4 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Snx8Q8CFD4 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Snx8Q8CFD4 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Snx8Q8CFD4 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Snx8Q8CFD4 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Snx8Q8CFD4 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Snx8Q8CFD4 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Snx8Q8CFD4 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Snx8Q8CFD4 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Snx8Q8CFD4 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Snx8Q8CFD4 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Snx8Q8CFD4 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Snx8Q8CFD4 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Snx8Q8CFD4 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Snx8Q8CFD4 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Snx8Q8CFD4 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Snx8Q8CFD4 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Snx8Q8CFD4 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Snx8Q8CFD4 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Snx8Q8CFD4 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Snx8Q8CFD4 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Snx8Q8CFD4 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Snx8Q8CFD4 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Snx8Q8CFD4 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Snx8Q8CFD4 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Snx8Q8CFD4 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Snx8Q8CFD4 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Snx8Q8CFD4 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Snx8Q8CFD4 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Snx8Q8CFD4 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Snx8Q8CFD4 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Snx8Q8CFD4 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Snx8Q8CFD4 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Snx8Q8CFD4 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Snx8Q8CFD4 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Snx8Q8CFD4 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Snx8Q8CFD4 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Snx8Q8CFD4 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Snx8Q8CFD4 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Snx8Q8CFD4 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Snx8Q8CFD4 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Snx8Q8CFD4 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Snx8Q8CFD4 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Snx8Q8CFD4 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Snx8Q8CFD4 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Snx8Q8CFD4 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Snx8Q8CFD4 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Snx8Q8CFD4 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Snx8Q8CFD4 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Snx8Q8CFD4 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Snx8Q8CFD4 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Snx8Q8CFD4 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Snx8Q8CFD4 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Snx8Q8CFD4 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Snx8Q8CFD4 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Snx8Q8CFD4 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Snx8Q8CFD4 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Snx8Q8CFD4 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Snx8Q8CFD4 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Snx8Q8CFD4 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Snx8Q8CFD4 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Snx8Q8CFD4 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Snx8Q8CFD4 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Snx8Q8CFD4 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms