Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFC7

Clasrp, CLK4-associating serine/arginine rich protein, mousemouse

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Length 668 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClasrpQ8CFC7 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ClasrpQ8CFC7 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC15.02■□□□□ -0
ClasrpQ8CFC7 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
ClasrpQ8CFC7 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ClasrpQ8CFC7 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ClasrpQ8CFC7 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC15.02■□□□□ -0
ClasrpQ8CFC7 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC15.02■□□□□ -0
ClasrpQ8CFC7 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC15.02■□□□□ -0
ClasrpQ8CFC7 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
ClasrpQ8CFC7 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ClasrpQ8CFC7 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ClasrpQ8CFC7 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
ClasrpQ8CFC7 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ClasrpQ8CFC7 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
ClasrpQ8CFC7 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ClasrpQ8CFC7 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
ClasrpQ8CFC7 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ClasrpQ8CFC7 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ClasrpQ8CFC7 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ClasrpQ8CFC7 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
ClasrpQ8CFC7 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ClasrpQ8CFC7 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ClasrpQ8CFC7 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ClasrpQ8CFC7 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ClasrpQ8CFC7 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ClasrpQ8CFC7 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ClasrpQ8CFC7 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ClasrpQ8CFC7 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ClasrpQ8CFC7 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ClasrpQ8CFC7 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ClasrpQ8CFC7 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ClasrpQ8CFC7 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ClasrpQ8CFC7 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ClasrpQ8CFC7 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ClasrpQ8CFC7 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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ClasrpQ8CFC7 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ClasrpQ8CFC7 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
ClasrpQ8CFC7 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
ClasrpQ8CFC7 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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ClasrpQ8CFC7 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
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ClasrpQ8CFC7 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ClasrpQ8CFC7 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ClasrpQ8CFC7 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ClasrpQ8CFC7 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ClasrpQ8CFC7 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ClasrpQ8CFC7 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ClasrpQ8CFC7 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ClasrpQ8CFC7 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC15□□□□□ -0.01
ClasrpQ8CFC7 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ClasrpQ8CFC7 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
ClasrpQ8CFC7 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
ClasrpQ8CFC7 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
ClasrpQ8CFC7 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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ClasrpQ8CFC7 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
ClasrpQ8CFC7 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC15□□□□□ -0.01
ClasrpQ8CFC7 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC15□□□□□ -0.01
ClasrpQ8CFC7 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
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ClasrpQ8CFC7 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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ClasrpQ8CFC7 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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ClasrpQ8CFC7 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
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ClasrpQ8CFC7 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ClasrpQ8CFC7 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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ClasrpQ8CFC7 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ClasrpQ8CFC7 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
ClasrpQ8CFC7 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ClasrpQ8CFC7 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ClasrpQ8CFC7 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ClasrpQ8CFC7 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
ClasrpQ8CFC7 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms