Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5U0

4933409G03Rik, RIKEN cDNA 4933409G03 gene, mousemouse

Predictions only

Length 320 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933409G03RikQ8C5U0 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
4933409G03RikQ8C5U0 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
4933409G03RikQ8C5U0 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
4933409G03RikQ8C5U0 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
4933409G03RikQ8C5U0 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
4933409G03RikQ8C5U0 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
4933409G03RikQ8C5U0 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
4933409G03RikQ8C5U0 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
4933409G03RikQ8C5U0 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
4933409G03RikQ8C5U0 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
4933409G03RikQ8C5U0 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
4933409G03RikQ8C5U0 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
4933409G03RikQ8C5U0 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
4933409G03RikQ8C5U0 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
4933409G03RikQ8C5U0 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
4933409G03RikQ8C5U0 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
4933409G03RikQ8C5U0 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
4933409G03RikQ8C5U0 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
4933409G03RikQ8C5U0 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
4933409G03RikQ8C5U0 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
4933409G03RikQ8C5U0 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
4933409G03RikQ8C5U0 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
4933409G03RikQ8C5U0 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
4933409G03RikQ8C5U0 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
4933409G03RikQ8C5U0 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
4933409G03RikQ8C5U0 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
4933409G03RikQ8C5U0 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
4933409G03RikQ8C5U0 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
4933409G03RikQ8C5U0 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
4933409G03RikQ8C5U0 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
4933409G03RikQ8C5U0 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
4933409G03RikQ8C5U0 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
4933409G03RikQ8C5U0 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
4933409G03RikQ8C5U0 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
4933409G03RikQ8C5U0 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
4933409G03RikQ8C5U0 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
4933409G03RikQ8C5U0 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
4933409G03RikQ8C5U0 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
4933409G03RikQ8C5U0 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
4933409G03RikQ8C5U0 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
4933409G03RikQ8C5U0 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
4933409G03RikQ8C5U0 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
4933409G03RikQ8C5U0 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
4933409G03RikQ8C5U0 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
4933409G03RikQ8C5U0 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
4933409G03RikQ8C5U0 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
4933409G03RikQ8C5U0 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
4933409G03RikQ8C5U0 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
4933409G03RikQ8C5U0 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
4933409G03RikQ8C5U0 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
4933409G03RikQ8C5U0 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
4933409G03RikQ8C5U0 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
4933409G03RikQ8C5U0 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
4933409G03RikQ8C5U0 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
4933409G03RikQ8C5U0 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
4933409G03RikQ8C5U0 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
4933409G03RikQ8C5U0 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
4933409G03RikQ8C5U0 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
4933409G03RikQ8C5U0 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
4933409G03RikQ8C5U0 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
4933409G03RikQ8C5U0 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
4933409G03RikQ8C5U0 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
4933409G03RikQ8C5U0 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
4933409G03RikQ8C5U0 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
4933409G03RikQ8C5U0 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
4933409G03RikQ8C5U0 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC15.08■□□□□ 0
4933409G03RikQ8C5U0 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
4933409G03RikQ8C5U0 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC15.08■□□□□ 0
4933409G03RikQ8C5U0 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC15.08■□□□□ 0
4933409G03RikQ8C5U0 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
4933409G03RikQ8C5U0 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
4933409G03RikQ8C5U0 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
4933409G03RikQ8C5U0 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
4933409G03RikQ8C5U0 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC15.08■□□□□ 0
4933409G03RikQ8C5U0 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
4933409G03RikQ8C5U0 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
4933409G03RikQ8C5U0 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
4933409G03RikQ8C5U0 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
4933409G03RikQ8C5U0 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
4933409G03RikQ8C5U0 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
4933409G03RikQ8C5U0 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
4933409G03RikQ8C5U0 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
4933409G03RikQ8C5U0 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
4933409G03RikQ8C5U0 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
4933409G03RikQ8C5U0 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
4933409G03RikQ8C5U0 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
4933409G03RikQ8C5U0 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
4933409G03RikQ8C5U0 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
4933409G03RikQ8C5U0 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
4933409G03RikQ8C5U0 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
4933409G03RikQ8C5U0 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC15.07■□□□□ 0
4933409G03RikQ8C5U0 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
4933409G03RikQ8C5U0 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
4933409G03RikQ8C5U0 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC15.07■□□□□ 0
4933409G03RikQ8C5U0 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
4933409G03RikQ8C5U0 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
4933409G03RikQ8C5U0 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC15.07■□□□□ 0
4933409G03RikQ8C5U0 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
4933409G03RikQ8C5U0 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC15.07■□□□□ 0
4933409G03RikQ8C5U0 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms