Protein–RNA interactions for Protein: Q8C1N8

Defa22, Alpha-defensin 22, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa22Q8C1N8 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Defa22Q8C1N8 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Defa22Q8C1N8 Plet1-201ENSMUST00000114474 1689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Defa22Q8C1N8 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Defa22Q8C1N8 Ambra1-203ENSMUST00000099712 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Defa22Q8C1N8 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Defa22Q8C1N8 Rsl1-201ENSMUST00000021997 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Defa22Q8C1N8 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Defa22Q8C1N8 Gm26883-201ENSMUST00000180945 4878 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Defa22Q8C1N8 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Defa22Q8C1N8 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Defa22Q8C1N8 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Defa22Q8C1N8 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Defa22Q8C1N8 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Defa22Q8C1N8 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Defa22Q8C1N8 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Defa22Q8C1N8 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Defa22Q8C1N8 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Defa22Q8C1N8 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Defa22Q8C1N8 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Defa22Q8C1N8 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Defa22Q8C1N8 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Defa22Q8C1N8 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Defa22Q8C1N8 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Defa22Q8C1N8 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Defa22Q8C1N8 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Defa22Q8C1N8 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Defa22Q8C1N8 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Defa22Q8C1N8 Usp22-201ENSMUST00000041683 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Defa22Q8C1N8 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Defa22Q8C1N8 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Defa22Q8C1N8 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Defa22Q8C1N8 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Defa22Q8C1N8 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Defa22Q8C1N8 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Defa22Q8C1N8 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Defa22Q8C1N8 A930024N18Rik-201ENSMUST00000181251 3955 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Defa22Q8C1N8 Evi5l-208ENSMUST00000176825 3728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Defa22Q8C1N8 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Defa22Q8C1N8 Pip4k2b-201ENSMUST00000018691 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Defa22Q8C1N8 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Defa22Q8C1N8 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Defa22Q8C1N8 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Defa22Q8C1N8 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Defa22Q8C1N8 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Defa22Q8C1N8 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Defa22Q8C1N8 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Defa22Q8C1N8 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Defa22Q8C1N8 Gm2822-201ENSMUST00000164299 2910 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Defa22Q8C1N8 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Defa22Q8C1N8 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Defa22Q8C1N8 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Defa22Q8C1N8 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Defa22Q8C1N8 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Defa22Q8C1N8 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Defa22Q8C1N8 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Defa22Q8C1N8 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Defa22Q8C1N8 Cic-212ENSMUST00000169266 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Defa22Q8C1N8 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Defa22Q8C1N8 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Defa22Q8C1N8 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Defa22Q8C1N8 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Defa22Q8C1N8 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Defa22Q8C1N8 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Defa22Q8C1N8 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Defa22Q8C1N8 Nol4-204ENSMUST00000097651 4549 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Defa22Q8C1N8 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Defa22Q8C1N8 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Defa22Q8C1N8 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Defa22Q8C1N8 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Defa22Q8C1N8 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Defa22Q8C1N8 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Defa22Q8C1N8 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Defa22Q8C1N8 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Defa22Q8C1N8 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Defa22Q8C1N8 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Defa22Q8C1N8 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Defa22Q8C1N8 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Defa22Q8C1N8 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Defa22Q8C1N8 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Defa22Q8C1N8 Dhx30-212ENSMUST00000197928 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Defa22Q8C1N8 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Defa22Q8C1N8 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Defa22Q8C1N8 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Defa22Q8C1N8 Fam206a-201ENSMUST00000045368 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Defa22Q8C1N8 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Defa22Q8C1N8 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Defa22Q8C1N8 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Defa22Q8C1N8 Ptpn11-201ENSMUST00000054547 5535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Defa22Q8C1N8 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Defa22Q8C1N8 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Defa22Q8C1N8 Flnc-201ENSMUST00000065090 9038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Defa22Q8C1N8 Gm31518-201ENSMUST00000211925 2548 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Defa22Q8C1N8 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Defa22Q8C1N8 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Defa22Q8C1N8 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Defa22Q8C1N8 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Defa22Q8C1N8 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Defa22Q8C1N8 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Defa22Q8C1N8 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.9 ms