Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0Q4

Nek11, Serine/threonine-protein kinase Nek11, mousemouse

Predictions only

Length 628 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek11Q8C0Q4 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
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Nek11Q8C0Q4 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
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Nek11Q8C0Q4 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
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Nek11Q8C0Q4 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nek11Q8C0Q4 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
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Nek11Q8C0Q4 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nek11Q8C0Q4 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Nek11Q8C0Q4 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nek11Q8C0Q4 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nek11Q8C0Q4 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
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Nek11Q8C0Q4 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nek11Q8C0Q4 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Nek11Q8C0Q4 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nek11Q8C0Q4 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nek11Q8C0Q4 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nek11Q8C0Q4 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nek11Q8C0Q4 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nek11Q8C0Q4 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nek11Q8C0Q4 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nek11Q8C0Q4 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nek11Q8C0Q4 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nek11Q8C0Q4 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nek11Q8C0Q4 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nek11Q8C0Q4 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nek11Q8C0Q4 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Nek11Q8C0Q4 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nek11Q8C0Q4 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nek11Q8C0Q4 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nek11Q8C0Q4 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nek11Q8C0Q4 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nek11Q8C0Q4 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nek11Q8C0Q4 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nek11Q8C0Q4 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
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Nek11Q8C0Q4 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Nek11Q8C0Q4 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
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