Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0C4

Ccser1, Serine-rich coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 895 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccser1Q8C0C4 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccser1Q8C0C4 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccser1Q8C0C4 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccser1Q8C0C4 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccser1Q8C0C4 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccser1Q8C0C4 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccser1Q8C0C4 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccser1Q8C0C4 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccser1Q8C0C4 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccser1Q8C0C4 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccser1Q8C0C4 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccser1Q8C0C4 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccser1Q8C0C4 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccser1Q8C0C4 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccser1Q8C0C4 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccser1Q8C0C4 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccser1Q8C0C4 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccser1Q8C0C4 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccser1Q8C0C4 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccser1Q8C0C4 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccser1Q8C0C4 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccser1Q8C0C4 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccser1Q8C0C4 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccser1Q8C0C4 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccser1Q8C0C4 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccser1Q8C0C4 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccser1Q8C0C4 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccser1Q8C0C4 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccser1Q8C0C4 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccser1Q8C0C4 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccser1Q8C0C4 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccser1Q8C0C4 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccser1Q8C0C4 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccser1Q8C0C4 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccser1Q8C0C4 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccser1Q8C0C4 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccser1Q8C0C4 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccser1Q8C0C4 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccser1Q8C0C4 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccser1Q8C0C4 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccser1Q8C0C4 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccser1Q8C0C4 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccser1Q8C0C4 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccser1Q8C0C4 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccser1Q8C0C4 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccser1Q8C0C4 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccser1Q8C0C4 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccser1Q8C0C4 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Ccser1Q8C0C4 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccser1Q8C0C4 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccser1Q8C0C4 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccser1Q8C0C4 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
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Ccser1Q8C0C4 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Ccser1Q8C0C4 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Ccser1Q8C0C4 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Ccser1Q8C0C4 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Ccser1Q8C0C4 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Ccser1Q8C0C4 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccser1Q8C0C4 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccser1Q8C0C4 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Ccser1Q8C0C4 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccser1Q8C0C4 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccser1Q8C0C4 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccser1Q8C0C4 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccser1Q8C0C4 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccser1Q8C0C4 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccser1Q8C0C4 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccser1Q8C0C4 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccser1Q8C0C4 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccser1Q8C0C4 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccser1Q8C0C4 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccser1Q8C0C4 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccser1Q8C0C4 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccser1Q8C0C4 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccser1Q8C0C4 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccser1Q8C0C4 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccser1Q8C0C4 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccser1Q8C0C4 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccser1Q8C0C4 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccser1Q8C0C4 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccser1Q8C0C4 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccser1Q8C0C4 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccser1Q8C0C4 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Ccser1Q8C0C4 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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