Protein–RNA interactions for Protein: Q8C080

Snx16, Sorting nexin-16, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx16Q8C080 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Snx16Q8C080 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Snx16Q8C080 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Snx16Q8C080 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Snx16Q8C080 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Snx16Q8C080 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Snx16Q8C080 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Snx16Q8C080 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Snx16Q8C080 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Snx16Q8C080 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Snx16Q8C080 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Snx16Q8C080 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Snx16Q8C080 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Snx16Q8C080 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Snx16Q8C080 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Snx16Q8C080 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Snx16Q8C080 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Snx16Q8C080 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Snx16Q8C080 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Snx16Q8C080 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Snx16Q8C080 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Snx16Q8C080 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Snx16Q8C080 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Snx16Q8C080 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Snx16Q8C080 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Snx16Q8C080 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Snx16Q8C080 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Snx16Q8C080 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Snx16Q8C080 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Snx16Q8C080 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Snx16Q8C080 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Snx16Q8C080 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Snx16Q8C080 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Snx16Q8C080 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Snx16Q8C080 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Snx16Q8C080 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Snx16Q8C080 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Snx16Q8C080 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Snx16Q8C080 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Snx16Q8C080 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Snx16Q8C080 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Snx16Q8C080 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Snx16Q8C080 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Snx16Q8C080 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Snx16Q8C080 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Snx16Q8C080 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Snx16Q8C080 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Snx16Q8C080 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Snx16Q8C080 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Snx16Q8C080 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Snx16Q8C080 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Snx16Q8C080 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Snx16Q8C080 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Snx16Q8C080 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Snx16Q8C080 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Snx16Q8C080 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Snx16Q8C080 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Snx16Q8C080 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Snx16Q8C080 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Snx16Q8C080 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Snx16Q8C080 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Snx16Q8C080 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Snx16Q8C080 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Snx16Q8C080 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Snx16Q8C080 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Snx16Q8C080 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Snx16Q8C080 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Snx16Q8C080 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Snx16Q8C080 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Snx16Q8C080 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Snx16Q8C080 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Snx16Q8C080 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Snx16Q8C080 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Snx16Q8C080 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Snx16Q8C080 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Snx16Q8C080 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Snx16Q8C080 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Snx16Q8C080 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Snx16Q8C080 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Snx16Q8C080 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Snx16Q8C080 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Snx16Q8C080 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Snx16Q8C080 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Snx16Q8C080 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Snx16Q8C080 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Snx16Q8C080 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Snx16Q8C080 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Snx16Q8C080 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Snx16Q8C080 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Snx16Q8C080 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Snx16Q8C080 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Snx16Q8C080 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Snx16Q8C080 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Snx16Q8C080 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Snx16Q8C080 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Snx16Q8C080 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Snx16Q8C080 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Snx16Q8C080 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms