Protein–RNA interactions for Protein: Q8C006

Trim35, Tripartite motif-containing protein 35, mousemouse

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Length 501 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim35Q8C006 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
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Trim35Q8C006 AC154724.1-201ENSMUST00000225782 821 ntBASIC15.05■□□□□ -0
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Trim35Q8C006 Gm13872-202ENSMUST00000143995 1408 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
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Trim35Q8C006 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trim35Q8C006 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
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Trim35Q8C006 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
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Trim35Q8C006 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
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Trim35Q8C006 1700027I24Rik-201ENSMUST00000183612 696 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
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Trim35Q8C006 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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Trim35Q8C006 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trim35Q8C006 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trim35Q8C006 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trim35Q8C006 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trim35Q8C006 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trim35Q8C006 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
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