Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX07

Ctdsp2, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 2, mousemouse

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Length 270 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdsp2Q8BX07 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ctdsp2Q8BX07 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ctdsp2Q8BX07 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ctdsp2Q8BX07 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ctdsp2Q8BX07 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ctdsp2Q8BX07 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ctdsp2Q8BX07 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ctdsp2Q8BX07 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ctdsp2Q8BX07 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Ctdsp2Q8BX07 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ctdsp2Q8BX07 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ctdsp2Q8BX07 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Ctdsp2Q8BX07 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ctdsp2Q8BX07 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ctdsp2Q8BX07 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ctdsp2Q8BX07 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ctdsp2Q8BX07 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ctdsp2Q8BX07 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ctdsp2Q8BX07 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ctdsp2Q8BX07 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Ctdsp2Q8BX07 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ctdsp2Q8BX07 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ctdsp2Q8BX07 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ctdsp2Q8BX07 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ctdsp2Q8BX07 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ctdsp2Q8BX07 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ctdsp2Q8BX07 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ctdsp2Q8BX07 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ctdsp2Q8BX07 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ctdsp2Q8BX07 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ctdsp2Q8BX07 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ctdsp2Q8BX07 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ctdsp2Q8BX07 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ctdsp2Q8BX07 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ctdsp2Q8BX07 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ctdsp2Q8BX07 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ctdsp2Q8BX07 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ctdsp2Q8BX07 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ctdsp2Q8BX07 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Ctdsp2Q8BX07 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Ctdsp2Q8BX07 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Ctdsp2Q8BX07 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Ctdsp2Q8BX07 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Ctdsp2Q8BX07 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ctdsp2Q8BX07 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ctdsp2Q8BX07 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ctdsp2Q8BX07 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ctdsp2Q8BX07 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ctdsp2Q8BX07 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ctdsp2Q8BX07 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ctdsp2Q8BX07 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Ctdsp2Q8BX07 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ctdsp2Q8BX07 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Ctdsp2Q8BX07 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ctdsp2Q8BX07 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ctdsp2Q8BX07 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Ctdsp2Q8BX07 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Ctdsp2Q8BX07 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ctdsp2Q8BX07 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ctdsp2Q8BX07 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ctdsp2Q8BX07 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ctdsp2Q8BX07 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ctdsp2Q8BX07 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ctdsp2Q8BX07 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ctdsp2Q8BX07 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ctdsp2Q8BX07 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ctdsp2Q8BX07 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ctdsp2Q8BX07 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ctdsp2Q8BX07 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ctdsp2Q8BX07 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ctdsp2Q8BX07 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ctdsp2Q8BX07 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ctdsp2Q8BX07 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ctdsp2Q8BX07 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ctdsp2Q8BX07 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ctdsp2Q8BX07 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ctdsp2Q8BX07 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ctdsp2Q8BX07 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ctdsp2Q8BX07 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ctdsp2Q8BX07 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ctdsp2Q8BX07 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ctdsp2Q8BX07 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ctdsp2Q8BX07 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ctdsp2Q8BX07 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Ctdsp2Q8BX07 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ctdsp2Q8BX07 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ctdsp2Q8BX07 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ctdsp2Q8BX07 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Ctdsp2Q8BX07 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ctdsp2Q8BX07 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Ctdsp2Q8BX07 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ctdsp2Q8BX07 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ctdsp2Q8BX07 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ctdsp2Q8BX07 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Ctdsp2Q8BX07 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ctdsp2Q8BX07 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ctdsp2Q8BX07 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ctdsp2Q8BX07 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ctdsp2Q8BX07 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ctdsp2Q8BX07 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
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