Protein–RNA interactions for Protein: Q8BW72

Kdm4a, Lysine-specific demethylase 4A, mousemouse

Predictions only

Length 1,064 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm4aQ8BW72 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Kdm4aQ8BW72 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Kdm4aQ8BW72 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Kdm4aQ8BW72 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Kdm4aQ8BW72 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Kdm4aQ8BW72 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Kdm4aQ8BW72 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Kdm4aQ8BW72 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Kdm4aQ8BW72 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Kdm4aQ8BW72 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Kdm4aQ8BW72 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Kdm4aQ8BW72 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Kdm4aQ8BW72 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Kdm4aQ8BW72 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Kdm4aQ8BW72 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Kdm4aQ8BW72 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Kdm4aQ8BW72 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Kdm4aQ8BW72 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Kdm4aQ8BW72 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Kdm4aQ8BW72 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Kdm4aQ8BW72 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Kdm4aQ8BW72 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Kdm4aQ8BW72 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Kdm4aQ8BW72 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Kdm4aQ8BW72 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Kdm4aQ8BW72 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Kdm4aQ8BW72 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Kdm4aQ8BW72 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Kdm4aQ8BW72 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Kdm4aQ8BW72 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Kdm4aQ8BW72 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Kdm4aQ8BW72 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Kdm4aQ8BW72 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Kdm4aQ8BW72 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Kdm4aQ8BW72 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Kdm4aQ8BW72 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Kdm4aQ8BW72 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Kdm4aQ8BW72 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Kdm4aQ8BW72 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Kdm4aQ8BW72 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Kdm4aQ8BW72 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Kdm4aQ8BW72 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Kdm4aQ8BW72 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Kdm4aQ8BW72 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Kdm4aQ8BW72 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Kdm4aQ8BW72 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Kdm4aQ8BW72 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Kdm4aQ8BW72 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Kdm4aQ8BW72 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kdm4aQ8BW72 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kdm4aQ8BW72 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kdm4aQ8BW72 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kdm4aQ8BW72 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kdm4aQ8BW72 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kdm4aQ8BW72 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kdm4aQ8BW72 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kdm4aQ8BW72 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kdm4aQ8BW72 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kdm4aQ8BW72 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kdm4aQ8BW72 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kdm4aQ8BW72 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Kdm4aQ8BW72 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kdm4aQ8BW72 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kdm4aQ8BW72 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kdm4aQ8BW72 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kdm4aQ8BW72 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kdm4aQ8BW72 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kdm4aQ8BW72 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kdm4aQ8BW72 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Kdm4aQ8BW72 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kdm4aQ8BW72 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kdm4aQ8BW72 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kdm4aQ8BW72 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kdm4aQ8BW72 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Kdm4aQ8BW72 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Kdm4aQ8BW72 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Kdm4aQ8BW72 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Kdm4aQ8BW72 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Kdm4aQ8BW72 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Kdm4aQ8BW72 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Kdm4aQ8BW72 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Kdm4aQ8BW72 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Kdm4aQ8BW72 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Kdm4aQ8BW72 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Kdm4aQ8BW72 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Kdm4aQ8BW72 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Kdm4aQ8BW72 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Kdm4aQ8BW72 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Kdm4aQ8BW72 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Kdm4aQ8BW72 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Kdm4aQ8BW72 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Kdm4aQ8BW72 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Kdm4aQ8BW72 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Kdm4aQ8BW72 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Kdm4aQ8BW72 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Kdm4aQ8BW72 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Kdm4aQ8BW72 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Kdm4aQ8BW72 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Kdm4aQ8BW72 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Kdm4aQ8BW72 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms