Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVL3

Snx17, Sorting nexin-17, mousemouse

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Length 470 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx17Q8BVL3 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snx17Q8BVL3 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snx17Q8BVL3 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snx17Q8BVL3 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Snx17Q8BVL3 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snx17Q8BVL3 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snx17Q8BVL3 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snx17Q8BVL3 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snx17Q8BVL3 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snx17Q8BVL3 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snx17Q8BVL3 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snx17Q8BVL3 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snx17Q8BVL3 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snx17Q8BVL3 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snx17Q8BVL3 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snx17Q8BVL3 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snx17Q8BVL3 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snx17Q8BVL3 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snx17Q8BVL3 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snx17Q8BVL3 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snx17Q8BVL3 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Snx17Q8BVL3 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snx17Q8BVL3 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snx17Q8BVL3 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snx17Q8BVL3 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snx17Q8BVL3 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snx17Q8BVL3 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Snx17Q8BVL3 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Snx17Q8BVL3 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snx17Q8BVL3 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snx17Q8BVL3 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snx17Q8BVL3 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snx17Q8BVL3 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snx17Q8BVL3 AC167229.2-201ENSMUST00000218902 675 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snx17Q8BVL3 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Snx17Q8BVL3 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snx17Q8BVL3 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snx17Q8BVL3 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snx17Q8BVL3 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snx17Q8BVL3 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snx17Q8BVL3 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snx17Q8BVL3 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snx17Q8BVL3 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snx17Q8BVL3 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.06
Snx17Q8BVL3 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snx17Q8BVL3 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snx17Q8BVL3 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snx17Q8BVL3 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snx17Q8BVL3 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snx17Q8BVL3 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Snx17Q8BVL3 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snx17Q8BVL3 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snx17Q8BVL3 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snx17Q8BVL3 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snx17Q8BVL3 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Snx17Q8BVL3 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snx17Q8BVL3 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Snx17Q8BVL3 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snx17Q8BVL3 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snx17Q8BVL3 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Snx17Q8BVL3 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snx17Q8BVL3 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snx17Q8BVL3 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snx17Q8BVL3 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snx17Q8BVL3 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snx17Q8BVL3 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snx17Q8BVL3 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snx17Q8BVL3 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snx17Q8BVL3 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snx17Q8BVL3 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snx17Q8BVL3 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx17Q8BVL3 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx17Q8BVL3 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx17Q8BVL3 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx17Q8BVL3 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx17Q8BVL3 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx17Q8BVL3 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx17Q8BVL3 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx17Q8BVL3 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx17Q8BVL3 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx17Q8BVL3 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx17Q8BVL3 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx17Q8BVL3 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx17Q8BVL3 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx17Q8BVL3 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx17Q8BVL3 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx17Q8BVL3 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx17Q8BVL3 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx17Q8BVL3 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx17Q8BVL3 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx17Q8BVL3 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx17Q8BVL3 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx17Q8BVL3 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx17Q8BVL3 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx17Q8BVL3 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx17Q8BVL3 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx17Q8BVL3 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx17Q8BVL3 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx17Q8BVL3 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx17Q8BVL3 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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