Protein–RNA interactions for Protein: Q8BV13

Cops7b, COP9 signalosome complex subunit 7b, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops7bQ8BV13 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Cops7bQ8BV13 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Cops7bQ8BV13 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Cops7bQ8BV13 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Cops7bQ8BV13 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Cops7bQ8BV13 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Cops7bQ8BV13 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Cops7bQ8BV13 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cops7bQ8BV13 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cops7bQ8BV13 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cops7bQ8BV13 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cops7bQ8BV13 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cops7bQ8BV13 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cops7bQ8BV13 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cops7bQ8BV13 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cops7bQ8BV13 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cops7bQ8BV13 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cops7bQ8BV13 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cops7bQ8BV13 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cops7bQ8BV13 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Cops7bQ8BV13 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cops7bQ8BV13 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cops7bQ8BV13 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cops7bQ8BV13 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cops7bQ8BV13 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cops7bQ8BV13 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cops7bQ8BV13 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cops7bQ8BV13 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cops7bQ8BV13 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cops7bQ8BV13 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cops7bQ8BV13 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cops7bQ8BV13 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cops7bQ8BV13 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cops7bQ8BV13 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cops7bQ8BV13 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cops7bQ8BV13 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cops7bQ8BV13 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cops7bQ8BV13 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cops7bQ8BV13 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cops7bQ8BV13 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Cops7bQ8BV13 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Cops7bQ8BV13 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Cops7bQ8BV13 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cops7bQ8BV13 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Cops7bQ8BV13 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cops7bQ8BV13 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cops7bQ8BV13 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Cops7bQ8BV13 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cops7bQ8BV13 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cops7bQ8BV13 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cops7bQ8BV13 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cops7bQ8BV13 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cops7bQ8BV13 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cops7bQ8BV13 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cops7bQ8BV13 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cops7bQ8BV13 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cops7bQ8BV13 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Cops7bQ8BV13 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cops7bQ8BV13 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cops7bQ8BV13 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cops7bQ8BV13 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cops7bQ8BV13 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Cops7bQ8BV13 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Cops7bQ8BV13 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cops7bQ8BV13 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cops7bQ8BV13 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cops7bQ8BV13 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cops7bQ8BV13 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cops7bQ8BV13 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cops7bQ8BV13 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cops7bQ8BV13 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cops7bQ8BV13 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cops7bQ8BV13 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cops7bQ8BV13 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cops7bQ8BV13 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cops7bQ8BV13 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cops7bQ8BV13 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cops7bQ8BV13 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cops7bQ8BV13 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cops7bQ8BV13 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cops7bQ8BV13 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cops7bQ8BV13 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Cops7bQ8BV13 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Cops7bQ8BV13 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cops7bQ8BV13 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cops7bQ8BV13 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cops7bQ8BV13 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cops7bQ8BV13 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cops7bQ8BV13 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cops7bQ8BV13 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cops7bQ8BV13 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cops7bQ8BV13 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cops7bQ8BV13 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cops7bQ8BV13 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cops7bQ8BV13 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cops7bQ8BV13 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cops7bQ8BV13 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cops7bQ8BV13 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cops7bQ8BV13 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cops7bQ8BV13 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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