Protein–RNA interactions for Protein: Q8BSU2

Cxcl16, C-X-C motif chemokine 16, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl16Q8BSU2 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Cxcl16Q8BSU2 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cxcl16Q8BSU2 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cxcl16Q8BSU2 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cxcl16Q8BSU2 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cxcl16Q8BSU2 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cxcl16Q8BSU2 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Cxcl16Q8BSU2 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cxcl16Q8BSU2 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cxcl16Q8BSU2 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cxcl16Q8BSU2 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cxcl16Q8BSU2 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Cxcl16Q8BSU2 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cxcl16Q8BSU2 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cxcl16Q8BSU2 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cxcl16Q8BSU2 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cxcl16Q8BSU2 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cxcl16Q8BSU2 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cxcl16Q8BSU2 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cxcl16Q8BSU2 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cxcl16Q8BSU2 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cxcl16Q8BSU2 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cxcl16Q8BSU2 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cxcl16Q8BSU2 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Cxcl16Q8BSU2 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Cxcl16Q8BSU2 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Cxcl16Q8BSU2 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cxcl16Q8BSU2 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cxcl16Q8BSU2 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cxcl16Q8BSU2 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cxcl16Q8BSU2 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cxcl16Q8BSU2 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cxcl16Q8BSU2 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cxcl16Q8BSU2 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cxcl16Q8BSU2 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cxcl16Q8BSU2 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cxcl16Q8BSU2 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cxcl16Q8BSU2 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cxcl16Q8BSU2 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cxcl16Q8BSU2 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cxcl16Q8BSU2 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cxcl16Q8BSU2 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cxcl16Q8BSU2 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cxcl16Q8BSU2 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cxcl16Q8BSU2 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cxcl16Q8BSU2 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cxcl16Q8BSU2 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cxcl16Q8BSU2 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Cxcl16Q8BSU2 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cxcl16Q8BSU2 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Cxcl16Q8BSU2 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Cxcl16Q8BSU2 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cxcl16Q8BSU2 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cxcl16Q8BSU2 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cxcl16Q8BSU2 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cxcl16Q8BSU2 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cxcl16Q8BSU2 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cxcl16Q8BSU2 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cxcl16Q8BSU2 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cxcl16Q8BSU2 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cxcl16Q8BSU2 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cxcl16Q8BSU2 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cxcl16Q8BSU2 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cxcl16Q8BSU2 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cxcl16Q8BSU2 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Cxcl16Q8BSU2 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cxcl16Q8BSU2 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Cxcl16Q8BSU2 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cxcl16Q8BSU2 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cxcl16Q8BSU2 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cxcl16Q8BSU2 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cxcl16Q8BSU2 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cxcl16Q8BSU2 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cxcl16Q8BSU2 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cxcl16Q8BSU2 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cxcl16Q8BSU2 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cxcl16Q8BSU2 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cxcl16Q8BSU2 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cxcl16Q8BSU2 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cxcl16Q8BSU2 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cxcl16Q8BSU2 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cxcl16Q8BSU2 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Cxcl16Q8BSU2 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Cxcl16Q8BSU2 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cxcl16Q8BSU2 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cxcl16Q8BSU2 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cxcl16Q8BSU2 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cxcl16Q8BSU2 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cxcl16Q8BSU2 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cxcl16Q8BSU2 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cxcl16Q8BSU2 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cxcl16Q8BSU2 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cxcl16Q8BSU2 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cxcl16Q8BSU2 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cxcl16Q8BSU2 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cxcl16Q8BSU2 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cxcl16Q8BSU2 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cxcl16Q8BSU2 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cxcl16Q8BSU2 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cxcl16Q8BSU2 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms