Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKS9

Pum3, Pumilio homolog 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pum3Q8BKS9 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pum3Q8BKS9 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pum3Q8BKS9 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pum3Q8BKS9 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pum3Q8BKS9 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pum3Q8BKS9 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pum3Q8BKS9 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Pum3Q8BKS9 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pum3Q8BKS9 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Pum3Q8BKS9 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Pum3Q8BKS9 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pum3Q8BKS9 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Pum3Q8BKS9 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pum3Q8BKS9 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pum3Q8BKS9 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pum3Q8BKS9 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pum3Q8BKS9 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pum3Q8BKS9 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pum3Q8BKS9 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pum3Q8BKS9 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pum3Q8BKS9 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pum3Q8BKS9 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pum3Q8BKS9 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pum3Q8BKS9 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pum3Q8BKS9 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pum3Q8BKS9 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pum3Q8BKS9 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pum3Q8BKS9 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pum3Q8BKS9 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pum3Q8BKS9 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pum3Q8BKS9 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pum3Q8BKS9 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pum3Q8BKS9 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pum3Q8BKS9 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pum3Q8BKS9 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pum3Q8BKS9 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pum3Q8BKS9 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pum3Q8BKS9 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pum3Q8BKS9 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pum3Q8BKS9 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pum3Q8BKS9 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pum3Q8BKS9 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pum3Q8BKS9 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pum3Q8BKS9 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pum3Q8BKS9 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pum3Q8BKS9 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pum3Q8BKS9 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pum3Q8BKS9 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pum3Q8BKS9 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pum3Q8BKS9 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pum3Q8BKS9 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pum3Q8BKS9 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pum3Q8BKS9 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pum3Q8BKS9 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pum3Q8BKS9 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pum3Q8BKS9 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pum3Q8BKS9 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pum3Q8BKS9 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pum3Q8BKS9 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pum3Q8BKS9 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pum3Q8BKS9 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pum3Q8BKS9 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pum3Q8BKS9 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pum3Q8BKS9 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pum3Q8BKS9 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pum3Q8BKS9 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pum3Q8BKS9 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Pum3Q8BKS9 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Pum3Q8BKS9 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pum3Q8BKS9 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pum3Q8BKS9 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Pum3Q8BKS9 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pum3Q8BKS9 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pum3Q8BKS9 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pum3Q8BKS9 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pum3Q8BKS9 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pum3Q8BKS9 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pum3Q8BKS9 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pum3Q8BKS9 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pum3Q8BKS9 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pum3Q8BKS9 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pum3Q8BKS9 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pum3Q8BKS9 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pum3Q8BKS9 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pum3Q8BKS9 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pum3Q8BKS9 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pum3Q8BKS9 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pum3Q8BKS9 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Pum3Q8BKS9 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pum3Q8BKS9 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pum3Q8BKS9 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pum3Q8BKS9 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pum3Q8BKS9 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pum3Q8BKS9 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pum3Q8BKS9 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pum3Q8BKS9 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pum3Q8BKS9 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pum3Q8BKS9 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Pum3Q8BKS9 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Pum3Q8BKS9 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms