Protein–RNA interactions for Protein: Q8BK35

Nop53, Ribosome biogenesis protein NOP53, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 484 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop53Q8BK35 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nop53Q8BK35 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nop53Q8BK35 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nop53Q8BK35 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nop53Q8BK35 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nop53Q8BK35 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Nop53Q8BK35 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nop53Q8BK35 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nop53Q8BK35 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nop53Q8BK35 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nop53Q8BK35 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nop53Q8BK35 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nop53Q8BK35 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nop53Q8BK35 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nop53Q8BK35 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nop53Q8BK35 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nop53Q8BK35 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nop53Q8BK35 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nop53Q8BK35 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nop53Q8BK35 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nop53Q8BK35 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nop53Q8BK35 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nop53Q8BK35 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nop53Q8BK35 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nop53Q8BK35 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Nop53Q8BK35 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Nop53Q8BK35 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nop53Q8BK35 Cox17-201ENSMUST00000050273 444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nop53Q8BK35 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nop53Q8BK35 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nop53Q8BK35 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nop53Q8BK35 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nop53Q8BK35 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Nop53Q8BK35 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nop53Q8BK35 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nop53Q8BK35 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nop53Q8BK35 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nop53Q8BK35 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nop53Q8BK35 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nop53Q8BK35 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nop53Q8BK35 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nop53Q8BK35 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nop53Q8BK35 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Nop53Q8BK35 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Nop53Q8BK35 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nop53Q8BK35 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Nop53Q8BK35 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Nop53Q8BK35 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Nop53Q8BK35 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nop53Q8BK35 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Nop53Q8BK35 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Nop53Q8BK35 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nop53Q8BK35 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Nop53Q8BK35 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nop53Q8BK35 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nop53Q8BK35 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nop53Q8BK35 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nop53Q8BK35 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nop53Q8BK35 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nop53Q8BK35 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nop53Q8BK35 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Nop53Q8BK35 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nop53Q8BK35 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nop53Q8BK35 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nop53Q8BK35 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nop53Q8BK35 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nop53Q8BK35 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nop53Q8BK35 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nop53Q8BK35 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nop53Q8BK35 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nop53Q8BK35 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nop53Q8BK35 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nop53Q8BK35 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nop53Q8BK35 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nop53Q8BK35 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Nop53Q8BK35 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nop53Q8BK35 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nop53Q8BK35 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nop53Q8BK35 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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