Protein–RNA interactions for Protein: Q8BHX3

Cdca8, Borealin, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdca8Q8BHX3 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdca8Q8BHX3 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdca8Q8BHX3 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdca8Q8BHX3 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdca8Q8BHX3 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdca8Q8BHX3 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdca8Q8BHX3 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdca8Q8BHX3 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdca8Q8BHX3 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdca8Q8BHX3 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdca8Q8BHX3 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdca8Q8BHX3 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdca8Q8BHX3 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdca8Q8BHX3 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdca8Q8BHX3 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdca8Q8BHX3 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdca8Q8BHX3 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdca8Q8BHX3 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdca8Q8BHX3 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdca8Q8BHX3 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdca8Q8BHX3 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdca8Q8BHX3 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdca8Q8BHX3 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdca8Q8BHX3 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdca8Q8BHX3 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdca8Q8BHX3 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdca8Q8BHX3 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdca8Q8BHX3 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdca8Q8BHX3 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdca8Q8BHX3 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdca8Q8BHX3 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdca8Q8BHX3 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdca8Q8BHX3 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdca8Q8BHX3 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdca8Q8BHX3 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdca8Q8BHX3 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdca8Q8BHX3 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdca8Q8BHX3 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdca8Q8BHX3 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdca8Q8BHX3 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdca8Q8BHX3 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdca8Q8BHX3 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdca8Q8BHX3 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdca8Q8BHX3 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdca8Q8BHX3 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdca8Q8BHX3 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdca8Q8BHX3 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdca8Q8BHX3 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdca8Q8BHX3 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdca8Q8BHX3 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdca8Q8BHX3 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdca8Q8BHX3 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdca8Q8BHX3 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdca8Q8BHX3 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdca8Q8BHX3 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdca8Q8BHX3 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdca8Q8BHX3 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdca8Q8BHX3 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdca8Q8BHX3 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdca8Q8BHX3 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdca8Q8BHX3 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdca8Q8BHX3 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdca8Q8BHX3 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdca8Q8BHX3 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdca8Q8BHX3 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdca8Q8BHX3 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdca8Q8BHX3 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdca8Q8BHX3 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdca8Q8BHX3 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdca8Q8BHX3 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdca8Q8BHX3 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdca8Q8BHX3 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdca8Q8BHX3 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdca8Q8BHX3 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdca8Q8BHX3 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdca8Q8BHX3 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Cdca8Q8BHX3 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cdca8Q8BHX3 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cdca8Q8BHX3 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cdca8Q8BHX3 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdca8Q8BHX3 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdca8Q8BHX3 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdca8Q8BHX3 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdca8Q8BHX3 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdca8Q8BHX3 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdca8Q8BHX3 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdca8Q8BHX3 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdca8Q8BHX3 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdca8Q8BHX3 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdca8Q8BHX3 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdca8Q8BHX3 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdca8Q8BHX3 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdca8Q8BHX3 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdca8Q8BHX3 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdca8Q8BHX3 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdca8Q8BHX3 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdca8Q8BHX3 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdca8Q8BHX3 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdca8Q8BHX3 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdca8Q8BHX3 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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