Protein–RNA interactions for Protein: Q80U56

Avl9, Late secretory pathway protein AVL9 homolog, mousemouse

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Length 649 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Avl9Q80U56 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Avl9Q80U56 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Avl9Q80U56 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Avl9Q80U56 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Avl9Q80U56 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Avl9Q80U56 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Avl9Q80U56 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Avl9Q80U56 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Avl9Q80U56 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Avl9Q80U56 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Avl9Q80U56 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Avl9Q80U56 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Avl9Q80U56 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Avl9Q80U56 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Avl9Q80U56 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Avl9Q80U56 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Avl9Q80U56 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Avl9Q80U56 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Avl9Q80U56 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Avl9Q80U56 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Avl9Q80U56 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Avl9Q80U56 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Avl9Q80U56 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Avl9Q80U56 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Avl9Q80U56 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Avl9Q80U56 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Avl9Q80U56 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Avl9Q80U56 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Avl9Q80U56 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Avl9Q80U56 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Avl9Q80U56 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Avl9Q80U56 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Avl9Q80U56 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Avl9Q80U56 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Avl9Q80U56 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Avl9Q80U56 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Avl9Q80U56 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Avl9Q80U56 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Avl9Q80U56 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Avl9Q80U56 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Avl9Q80U56 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Avl9Q80U56 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Avl9Q80U56 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Avl9Q80U56 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Avl9Q80U56 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Avl9Q80U56 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Avl9Q80U56 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Avl9Q80U56 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Avl9Q80U56 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Avl9Q80U56 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Avl9Q80U56 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Avl9Q80U56 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Avl9Q80U56 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Avl9Q80U56 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Avl9Q80U56 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Avl9Q80U56 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Avl9Q80U56 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Avl9Q80U56 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
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Avl9Q80U56 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Avl9Q80U56 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Avl9Q80U56 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Avl9Q80U56 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.26
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Avl9Q80U56 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Avl9Q80U56 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Avl9Q80U56 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Avl9Q80U56 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Avl9Q80U56 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Avl9Q80U56 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Avl9Q80U56 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Avl9Q80U56 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Avl9Q80U56 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Avl9Q80U56 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Avl9Q80U56 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Avl9Q80U56 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Avl9Q80U56 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Avl9Q80U56 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Avl9Q80U56 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Avl9Q80U56 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Avl9Q80U56 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Avl9Q80U56 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Avl9Q80U56 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Avl9Q80U56 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Avl9Q80U56 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Avl9Q80U56 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Avl9Q80U56 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Avl9Q80U56 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Avl9Q80U56 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Avl9Q80U56 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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