Protein–RNA interactions for Protein: Q80TM9

Nisch, Nischarin, mousemouse

Predictions only

Length 1,593 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NischQ80TM9 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
NischQ80TM9 Fbxw4-203ENSMUST00000160003 387 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
NischQ80TM9 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC28.42■■■□□ 2.14
NischQ80TM9 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
NischQ80TM9 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
NischQ80TM9 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
NischQ80TM9 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
NischQ80TM9 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
NischQ80TM9 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
NischQ80TM9 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
NischQ80TM9 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
NischQ80TM9 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
NischQ80TM9 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
NischQ80TM9 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
NischQ80TM9 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
NischQ80TM9 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
NischQ80TM9 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
NischQ80TM9 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
NischQ80TM9 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
NischQ80TM9 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
NischQ80TM9 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
NischQ80TM9 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
NischQ80TM9 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
NischQ80TM9 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
NischQ80TM9 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
NischQ80TM9 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
NischQ80TM9 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
NischQ80TM9 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
NischQ80TM9 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
NischQ80TM9 Nkx2-2os-202ENSMUST00000184407 458 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
NischQ80TM9 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
NischQ80TM9 Gm43138-201ENSMUST00000199123 708 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
NischQ80TM9 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
NischQ80TM9 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
NischQ80TM9 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
NischQ80TM9 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
NischQ80TM9 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
NischQ80TM9 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
NischQ80TM9 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
NischQ80TM9 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
NischQ80TM9 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC28.4■■■□□ 2.14
NischQ80TM9 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
NischQ80TM9 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
NischQ80TM9 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
NischQ80TM9 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
NischQ80TM9 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
NischQ80TM9 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
NischQ80TM9 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
NischQ80TM9 Gm38317-201ENSMUST00000195564 343 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
NischQ80TM9 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
NischQ80TM9 Gm45418-202ENSMUST00000210693 649 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
NischQ80TM9 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
NischQ80TM9 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC28.4■■■□□ 2.14
NischQ80TM9 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
NischQ80TM9 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
NischQ80TM9 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
NischQ80TM9 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
NischQ80TM9 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
NischQ80TM9 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
NischQ80TM9 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
NischQ80TM9 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
NischQ80TM9 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
NischQ80TM9 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
NischQ80TM9 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
NischQ80TM9 Gm13115-201ENSMUST00000156438 620 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
NischQ80TM9 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
NischQ80TM9 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
NischQ80TM9 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
NischQ80TM9 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
NischQ80TM9 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
NischQ80TM9 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
NischQ80TM9 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
NischQ80TM9 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
NischQ80TM9 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
NischQ80TM9 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
NischQ80TM9 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
NischQ80TM9 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
NischQ80TM9 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
NischQ80TM9 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
NischQ80TM9 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
NischQ80TM9 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
NischQ80TM9 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
NischQ80TM9 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
NischQ80TM9 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
NischQ80TM9 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
NischQ80TM9 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
NischQ80TM9 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
NischQ80TM9 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
NischQ80TM9 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
NischQ80TM9 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
NischQ80TM9 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
NischQ80TM9 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
NischQ80TM9 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
NischQ80TM9 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
NischQ80TM9 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
NischQ80TM9 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
NischQ80TM9 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
NischQ80TM9 Gm25732-201ENSMUST00000175168 60 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
NischQ80TM9 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
NischQ80TM9 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms