Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF1

Dsg1b, Desmoglein-1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,060 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1bQ7TSF1 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Dsg1bQ7TSF1 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Dsg1bQ7TSF1 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Dsg1bQ7TSF1 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Dsg1bQ7TSF1 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Dsg1bQ7TSF1 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Dsg1bQ7TSF1 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Dsg1bQ7TSF1 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Dsg1bQ7TSF1 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Dsg1bQ7TSF1 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Dsg1bQ7TSF1 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Dsg1bQ7TSF1 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Dsg1bQ7TSF1 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Dsg1bQ7TSF1 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Dsg1bQ7TSF1 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Dsg1bQ7TSF1 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Dsg1bQ7TSF1 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Dsg1bQ7TSF1 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Dsg1bQ7TSF1 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Dsg1bQ7TSF1 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
Dsg1bQ7TSF1 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
Dsg1bQ7TSF1 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
Dsg1bQ7TSF1 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
Dsg1bQ7TSF1 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Dsg1bQ7TSF1 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Dsg1bQ7TSF1 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Dsg1bQ7TSF1 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Dsg1bQ7TSF1 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
Dsg1bQ7TSF1 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Dsg1bQ7TSF1 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Dsg1bQ7TSF1 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Dsg1bQ7TSF1 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
Dsg1bQ7TSF1 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Dsg1bQ7TSF1 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Dsg1bQ7TSF1 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Dsg1bQ7TSF1 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Dsg1bQ7TSF1 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Dsg1bQ7TSF1 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Dsg1bQ7TSF1 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Dsg1bQ7TSF1 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Dsg1bQ7TSF1 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Dsg1bQ7TSF1 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Dsg1bQ7TSF1 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Dsg1bQ7TSF1 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Dsg1bQ7TSF1 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Dsg1bQ7TSF1 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Dsg1bQ7TSF1 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Dsg1bQ7TSF1 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Dsg1bQ7TSF1 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Dsg1bQ7TSF1 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Dsg1bQ7TSF1 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Dsg1bQ7TSF1 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Dsg1bQ7TSF1 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
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Dsg1bQ7TSF1 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Dsg1bQ7TSF1 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Dsg1bQ7TSF1 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Dsg1bQ7TSF1 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
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Dsg1bQ7TSF1 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
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Dsg1bQ7TSF1 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
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Dsg1bQ7TSF1 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Dsg1bQ7TSF1 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Dsg1bQ7TSF1 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Dsg1bQ7TSF1 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Dsg1bQ7TSF1 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Dsg1bQ7TSF1 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Dsg1bQ7TSF1 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
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Dsg1bQ7TSF1 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Dsg1bQ7TSF1 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Dsg1bQ7TSF1 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Dsg1bQ7TSF1 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Dsg1bQ7TSF1 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Dsg1bQ7TSF1 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Dsg1bQ7TSF1 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Dsg1bQ7TSF1 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Dsg1bQ7TSF1 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Dsg1bQ7TSF1 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Dsg1bQ7TSF1 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Dsg1bQ7TSF1 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Dsg1bQ7TSF1 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Dsg1bQ7TSF1 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Dsg1bQ7TSF1 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Dsg1bQ7TSF1 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Dsg1bQ7TSF1 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Dsg1bQ7TSF1 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
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