Protein–RNA interactions for Protein: Q7TQ69

Tmc3, Transmembrane channel-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,130 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmc3Q7TQ69 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmc3Q7TQ69 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmc3Q7TQ69 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmc3Q7TQ69 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmc3Q7TQ69 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmc3Q7TQ69 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmc3Q7TQ69 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmc3Q7TQ69 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmc3Q7TQ69 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmc3Q7TQ69 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmc3Q7TQ69 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmc3Q7TQ69 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmc3Q7TQ69 Gm14201-201ENSMUST00000117627 289 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmc3Q7TQ69 Gm14740-201ENSMUST00000118538 1150 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmc3Q7TQ69 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmc3Q7TQ69 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmc3Q7TQ69 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmc3Q7TQ69 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmc3Q7TQ69 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmc3Q7TQ69 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmc3Q7TQ69 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmc3Q7TQ69 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmc3Q7TQ69 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmc3Q7TQ69 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmc3Q7TQ69 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmc3Q7TQ69 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmc3Q7TQ69 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmc3Q7TQ69 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmc3Q7TQ69 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmc3Q7TQ69 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmc3Q7TQ69 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmc3Q7TQ69 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmc3Q7TQ69 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmc3Q7TQ69 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmc3Q7TQ69 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmc3Q7TQ69 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmc3Q7TQ69 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmc3Q7TQ69 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmc3Q7TQ69 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmc3Q7TQ69 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmc3Q7TQ69 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmc3Q7TQ69 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmc3Q7TQ69 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmc3Q7TQ69 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmc3Q7TQ69 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmc3Q7TQ69 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmc3Q7TQ69 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmc3Q7TQ69 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmc3Q7TQ69 Gm16107-201ENSMUST00000162523 862 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmc3Q7TQ69 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmc3Q7TQ69 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmc3Q7TQ69 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmc3Q7TQ69 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmc3Q7TQ69 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmc3Q7TQ69 AC153912.1-201ENSMUST00000217011 724 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmc3Q7TQ69 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmc3Q7TQ69 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmc3Q7TQ69 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmc3Q7TQ69 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmc3Q7TQ69 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmc3Q7TQ69 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmc3Q7TQ69 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmc3Q7TQ69 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmc3Q7TQ69 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmc3Q7TQ69 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmc3Q7TQ69 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmc3Q7TQ69 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmc3Q7TQ69 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmc3Q7TQ69 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmc3Q7TQ69 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmc3Q7TQ69 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmc3Q7TQ69 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmc3Q7TQ69 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmc3Q7TQ69 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmc3Q7TQ69 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmc3Q7TQ69 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmc3Q7TQ69 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmc3Q7TQ69 Atp6v1c2-207ENSMUST00000156727 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmc3Q7TQ69 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmc3Q7TQ69 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmc3Q7TQ69 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmc3Q7TQ69 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmc3Q7TQ69 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmc3Q7TQ69 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmc3Q7TQ69 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmc3Q7TQ69 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmc3Q7TQ69 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmc3Q7TQ69 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmc3Q7TQ69 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmc3Q7TQ69 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmc3Q7TQ69 Rnase9-201ENSMUST00000064214 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmc3Q7TQ69 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmc3Q7TQ69 Prl6a1-201ENSMUST00000091679 1093 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmc3Q7TQ69 Prl6a1-202ENSMUST00000091680 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmc3Q7TQ69 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmc3Q7TQ69 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmc3Q7TQ69 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmc3Q7TQ69 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmc3Q7TQ69 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmc3Q7TQ69 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.2 ms