Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNK4

Zfp397, Zinc finger protein 397, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp397Q7TNK4 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Zfp397Q7TNK4 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zfp397Q7TNK4 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Zfp397Q7TNK4 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Zfp397Q7TNK4 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Zfp397Q7TNK4 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zfp397Q7TNK4 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Zfp397Q7TNK4 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zfp397Q7TNK4 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zfp397Q7TNK4 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zfp397Q7TNK4 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zfp397Q7TNK4 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zfp397Q7TNK4 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zfp397Q7TNK4 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Zfp397Q7TNK4 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zfp397Q7TNK4 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Zfp397Q7TNK4 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zfp397Q7TNK4 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zfp397Q7TNK4 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zfp397Q7TNK4 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zfp397Q7TNK4 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zfp397Q7TNK4 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zfp397Q7TNK4 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zfp397Q7TNK4 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Zfp397Q7TNK4 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zfp397Q7TNK4 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zfp397Q7TNK4 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Zfp397Q7TNK4 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Zfp397Q7TNK4 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zfp397Q7TNK4 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zfp397Q7TNK4 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zfp397Q7TNK4 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zfp397Q7TNK4 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zfp397Q7TNK4 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zfp397Q7TNK4 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zfp397Q7TNK4 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zfp397Q7TNK4 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp397Q7TNK4 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp397Q7TNK4 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp397Q7TNK4 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp397Q7TNK4 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp397Q7TNK4 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp397Q7TNK4 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp397Q7TNK4 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp397Q7TNK4 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp397Q7TNK4 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp397Q7TNK4 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp397Q7TNK4 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp397Q7TNK4 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp397Q7TNK4 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp397Q7TNK4 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp397Q7TNK4 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp397Q7TNK4 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp397Q7TNK4 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp397Q7TNK4 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp397Q7TNK4 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp397Q7TNK4 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp397Q7TNK4 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp397Q7TNK4 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp397Q7TNK4 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp397Q7TNK4 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp397Q7TNK4 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp397Q7TNK4 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp397Q7TNK4 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp397Q7TNK4 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp397Q7TNK4 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp397Q7TNK4 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp397Q7TNK4 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp397Q7TNK4 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp397Q7TNK4 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zfp397Q7TNK4 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zfp397Q7TNK4 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zfp397Q7TNK4 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zfp397Q7TNK4 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zfp397Q7TNK4 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zfp397Q7TNK4 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zfp397Q7TNK4 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zfp397Q7TNK4 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zfp397Q7TNK4 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zfp397Q7TNK4 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zfp397Q7TNK4 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zfp397Q7TNK4 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Zfp397Q7TNK4 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zfp397Q7TNK4 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zfp397Q7TNK4 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zfp397Q7TNK4 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zfp397Q7TNK4 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Zfp397Q7TNK4 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zfp397Q7TNK4 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zfp397Q7TNK4 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zfp397Q7TNK4 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zfp397Q7TNK4 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zfp397Q7TNK4 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zfp397Q7TNK4 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zfp397Q7TNK4 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zfp397Q7TNK4 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zfp397Q7TNK4 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zfp397Q7TNK4 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Zfp397Q7TNK4 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zfp397Q7TNK4 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms