Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNB8

Sbno2, Protein strawberry notch homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sbno2Q7TNB8 Dleu2-212ENSMUST00000183079 535 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sbno2Q7TNB8 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Sbno2Q7TNB8 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sbno2Q7TNB8 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Sbno2Q7TNB8 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Sbno2Q7TNB8 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sbno2Q7TNB8 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sbno2Q7TNB8 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sbno2Q7TNB8 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sbno2Q7TNB8 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sbno2Q7TNB8 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sbno2Q7TNB8 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sbno2Q7TNB8 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sbno2Q7TNB8 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Sbno2Q7TNB8 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sbno2Q7TNB8 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sbno2Q7TNB8 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sbno2Q7TNB8 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sbno2Q7TNB8 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sbno2Q7TNB8 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sbno2Q7TNB8 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sbno2Q7TNB8 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sbno2Q7TNB8 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sbno2Q7TNB8 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sbno2Q7TNB8 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sbno2Q7TNB8 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sbno2Q7TNB8 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sbno2Q7TNB8 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sbno2Q7TNB8 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sbno2Q7TNB8 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sbno2Q7TNB8 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sbno2Q7TNB8 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sbno2Q7TNB8 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Sbno2Q7TNB8 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sbno2Q7TNB8 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sbno2Q7TNB8 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Sbno2Q7TNB8 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sbno2Q7TNB8 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sbno2Q7TNB8 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sbno2Q7TNB8 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Sbno2Q7TNB8 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sbno2Q7TNB8 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sbno2Q7TNB8 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sbno2Q7TNB8 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sbno2Q7TNB8 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sbno2Q7TNB8 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sbno2Q7TNB8 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sbno2Q7TNB8 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sbno2Q7TNB8 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sbno2Q7TNB8 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sbno2Q7TNB8 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sbno2Q7TNB8 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sbno2Q7TNB8 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sbno2Q7TNB8 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sbno2Q7TNB8 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sbno2Q7TNB8 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sbno2Q7TNB8 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Sbno2Q7TNB8 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sbno2Q7TNB8 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sbno2Q7TNB8 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Sbno2Q7TNB8 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sbno2Q7TNB8 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sbno2Q7TNB8 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Sbno2Q7TNB8 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sbno2Q7TNB8 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sbno2Q7TNB8 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sbno2Q7TNB8 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Sbno2Q7TNB8 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Sbno2Q7TNB8 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sbno2Q7TNB8 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sbno2Q7TNB8 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sbno2Q7TNB8 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sbno2Q7TNB8 Gm29019-202ENSMUST00000188623 564 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sbno2Q7TNB8 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sbno2Q7TNB8 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sbno2Q7TNB8 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sbno2Q7TNB8 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sbno2Q7TNB8 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sbno2Q7TNB8 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sbno2Q7TNB8 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sbno2Q7TNB8 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sbno2Q7TNB8 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sbno2Q7TNB8 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Sbno2Q7TNB8 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sbno2Q7TNB8 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sbno2Q7TNB8 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sbno2Q7TNB8 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sbno2Q7TNB8 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sbno2Q7TNB8 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sbno2Q7TNB8 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sbno2Q7TNB8 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sbno2Q7TNB8 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Sbno2Q7TNB8 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sbno2Q7TNB8 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sbno2Q7TNB8 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sbno2Q7TNB8 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sbno2Q7TNB8 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sbno2Q7TNB8 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sbno2Q7TNB8 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sbno2Q7TNB8 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms