Protein–RNA interactions for Protein: Q7M729

Scn4b, Sodium channel subunit beta-4, mousemouse

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn4bQ7M729 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Scn4bQ7M729 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Scn4bQ7M729 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Scn4bQ7M729 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Scn4bQ7M729 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Scn4bQ7M729 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Scn4bQ7M729 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Scn4bQ7M729 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Scn4bQ7M729 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Scn4bQ7M729 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Scn4bQ7M729 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Scn4bQ7M729 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Scn4bQ7M729 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Scn4bQ7M729 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Scn4bQ7M729 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Scn4bQ7M729 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Scn4bQ7M729 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Scn4bQ7M729 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Scn4bQ7M729 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Scn4bQ7M729 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Scn4bQ7M729 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Scn4bQ7M729 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Scn4bQ7M729 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Scn4bQ7M729 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Scn4bQ7M729 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Scn4bQ7M729 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Scn4bQ7M729 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Scn4bQ7M729 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Scn4bQ7M729 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Scn4bQ7M729 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Scn4bQ7M729 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Scn4bQ7M729 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Scn4bQ7M729 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Scn4bQ7M729 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Scn4bQ7M729 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Scn4bQ7M729 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Scn4bQ7M729 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Scn4bQ7M729 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Scn4bQ7M729 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Scn4bQ7M729 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Scn4bQ7M729 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Scn4bQ7M729 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Scn4bQ7M729 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Scn4bQ7M729 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Scn4bQ7M729 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Scn4bQ7M729 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Scn4bQ7M729 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Scn4bQ7M729 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Scn4bQ7M729 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Scn4bQ7M729 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Scn4bQ7M729 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Scn4bQ7M729 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Scn4bQ7M729 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Scn4bQ7M729 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
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Scn4bQ7M729 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Scn4bQ7M729 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Scn4bQ7M729 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
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Scn4bQ7M729 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Scn4bQ7M729 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Scn4bQ7M729 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Scn4bQ7M729 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Scn4bQ7M729 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Scn4bQ7M729 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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Scn4bQ7M729 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Scn4bQ7M729 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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Scn4bQ7M729 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Scn4bQ7M729 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Scn4bQ7M729 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Scn4bQ7M729 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Scn4bQ7M729 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Scn4bQ7M729 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Scn4bQ7M729 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Scn4bQ7M729 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Scn4bQ7M729 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Scn4bQ7M729 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Scn4bQ7M729 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Scn4bQ7M729 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Scn4bQ7M729 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Scn4bQ7M729 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Scn4bQ7M729 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Scn4bQ7M729 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Scn4bQ7M729 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Scn4bQ7M729 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Scn4bQ7M729 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Scn4bQ7M729 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Scn4bQ7M729 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Scn4bQ7M729 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Scn4bQ7M729 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Scn4bQ7M729 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Scn4bQ7M729 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Scn4bQ7M729 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Scn4bQ7M729 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Scn4bQ7M729 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Scn4bQ7M729 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.4 ms